42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29890 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 92 aa  183  5e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  57.61 
 
 		 87 aa  95.9  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  56.52 
 
 		 84 aa  90.9  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  58.67 
 
 		 107 aa  85.9  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  58.67 
 
 		 89 aa  83.6  8e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  52.7 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  59.46 
 
 		 84 aa  80.5  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  44.94 
 
 		 89 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  56.45 
 
 		 158 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  46.58 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  48.96 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  40.48 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  45.24 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  47.54 
 
 		 147 aa  71.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  49.33 
 
 		 82 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  57.89 
 
 		 93 aa  69.7  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 151 aa  68.6  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 85 aa  67.8  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  49.23 
 
 		 87 aa  64.7  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  40.54 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  47.37 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  51.39 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.04 
 
 		 81 aa  58.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  39.24 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  39.24 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  39.24 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  38.75 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  58.33 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  43.37 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  56.45 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  29.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  35.38 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  56.36 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  35.96 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  53.62 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  38.71 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.24 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  52.63 
 
 		 210 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  43.84 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  33.87 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>