55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0293 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
87 aa  172  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  52 
 
 
89 aa  78.6  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  53.73 
 
 
158 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  41.46 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  41.77 
 
 
89 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  58.18 
 
 
84 aa  73.6  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  43.24 
 
 
151 aa  70.1  0.000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  35.63 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  47.95 
 
 
85 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  43.42 
 
 
168 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 
88 aa  67.8  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  43.84 
 
 
92 aa  67.4  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  45.12 
 
 
87 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 
84 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  41.77 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  41.77 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  41.77 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1621  preprotein translocase subunit SecE  37.84 
 
 
75 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00100647  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  41.94 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3939  preprotein translocase, SecE subunit  62.5 
 
 
126 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 
147 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  45.83 
 
 
93 aa  58.5  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  48.39 
 
 
87 aa  57  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  48.08 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  55.56 
 
 
210 aa  56.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1218  preprotein translocase, SecE subunit  35.14 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000979518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  54.55 
 
 
82 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  35.48 
 
 
151 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0694  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  48 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  42.37 
 
 
83 aa  50.8  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  52.73 
 
 
77 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 
92 aa  51.2  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  44.93 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  30.19 
 
 
72 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  47.83 
 
 
60 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  30.19 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  30.19 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21040  preprotein translocase, SecE subunit  38.37 
 
 
98 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.245157  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0574  preprotein translocase, SecE subunit  32.56 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.881053  hitchhiker  0.0062556 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  43.48 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  37.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  46.51 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.24 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  34.78 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
72 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  33.93 
 
 
63 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>