38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2726 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 85 aa  175  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  50 
 
 		 80 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  37.68 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  44 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 		 85 aa  47.4  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0272  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000196165  hitchhiker  0.00824344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2660  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.54 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220907  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  51.11 
 
 		 51 aa  45.1  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  30.95 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 157 aa  43.5  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0209  preprotein translocase subunit SecE  37.88 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000117834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  34.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  34.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  34.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  32.91 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  38.64 
 
 		 126 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  32.65 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  35.42 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  36.54 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  29.27 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  34.78 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 77 aa  40.4  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.78 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 84 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2183  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 162 aa  40  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0165979  decreased coverage  0.00917802 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1893  preprotein translocase subunit SecE  35.71 
 
 		 162 aa  40  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0127051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3040  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 126 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.078937 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>