81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_1931 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 129 aa  259  1e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  58.82 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0209  preprotein translocase subunit SecE  58.73 
 
 		 113 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000117834  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0272  preprotein translocase subunit SecE  52.54 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000196165  hitchhiker  0.00824344 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  50.94 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  50.88 
 
 		 72 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  36.25 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 63 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  44.07 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  30.3 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 		 123 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  53.7 
 
 		 122 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  28.7 
 
 		 130 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 		 60 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  29.67 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  30.16 
 
 		 115 aa  45.4  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  32.95 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 123 aa  44.7  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  37.84 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  39.02 
 
 		 144 aa  43.9  0.0007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 65 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  51.06 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  37.63 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.29 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  26.37 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  39.66 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  36.17 
 
 		 147 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 		 60 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  41.27 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 144 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 157 aa  42  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 		 187 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  34.62 
 
 		 84 aa  42  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 62 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  39.68 
 
 		 66 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  45.95 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  43.18 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.43 
 
 		 122 aa  41.6  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  44.23 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  42.22 
 
 		 125 aa  40.8  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.8  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  42.22 
 
 		 127 aa  40.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 		 168 aa  40  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 63 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  42.11 
 
 		 114 aa  40  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>