62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0209 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_0209  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 113 aa  222  1e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000117834  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  48.39 
 
 		 129 aa  84  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  48.65 
 
 		 80 aa  74.7  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  57.41 
 
 		 79 aa  68.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0272  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000196165  hitchhiker  0.00824344 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  48.57 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  48 
 
 		 63 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 60 aa  51.2  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  54.35 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  40.24 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  55.32 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  48.94 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  32.32 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5966  preprotein translocase SecE subunit  32.91 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.741704  normal  0.926785 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3598  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 127 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  48.94 
 
 		 125 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  39.44 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  27.1 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  42.65 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2258  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 144 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.479635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 60 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  43.75 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  46 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4526  preprotein translocase, SecE subunit  45.76 
 
 		 210 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  34.94 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  41.07 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 		 65 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4537  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0688027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  29.81 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 72 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  55.26 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4448  preprotein translocase subunit SecE  43.75 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00605491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0582  preprotein translocase subunit SecE  41.67 
 
 		 127 aa  41.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 72 aa  41.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  37.25 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  43.48 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  46.34 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.82 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0040  preprotein translocase, SecE subunit  46.94 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  42.59 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  41.86 
 
 		 51 aa  40.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  51.06 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>