40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0886 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 72 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  95.83 
 
 		 72 aa  142  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  94.44 
 
 		 72 aa  141  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  46.97 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0519  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 		 115 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  49.12 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  41.27 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.3 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  35.94 
 
 		 72 aa  47  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  43.55 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  44.9 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  37.14 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  39.68 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  32.86 
 
 		 80 aa  44.3  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  43.9 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  43.9 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  30.19 
 
 		 87 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  35.62 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  41.46 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  33.77 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1952  preprotein translocase, SecE subunit  46.3 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000115861  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  38.3 
 
 		 132 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 		 158 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 73 aa  41.2  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.74 
 
 		 115 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  41.18 
 
 		 63 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  31.03 
 
 		 63 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  33.9 
 
 		 135 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>