110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0096 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 
60 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  83.33 
 
 
60 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  63.79 
 
 
59 aa  84  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  66.07 
 
 
59 aa  82.4  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  63.16 
 
 
63 aa  80.9  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  64.29 
 
 
59 aa  80.9  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  52.54 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  52.54 
 
 
60 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  50.88 
 
 
60 aa  62  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  46.43 
 
 
161 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  44.64 
 
 
147 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 
130 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 
60 aa  55.1  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  40.68 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 
147 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
89 aa  53.1  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  46.55 
 
 
86 aa  52.4  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  48.15 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 
63 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
73 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
66 aa  51.6  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  45.24 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  52.38 
 
 
51 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  38.33 
 
 
65 aa  50.8  0.000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4006  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
92 aa  50.8  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.031669 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.09 
 
 
83 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 
89 aa  48.9  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 
62 aa  48.9  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2678  preprotein translocase, SecE subunit  49.12 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  46.67 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  36.67 
 
 
62 aa  47  0.00008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  42.11 
 
 
87 aa  47.4  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
79 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
80 aa  47  0.00009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
77 aa  47  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  38.89 
 
 
82 aa  47  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
64 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  40.35 
 
 
168 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
83 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.82 
 
 
115 aa  45.4  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  32.14 
 
 
187 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  42.86 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 
116 aa  45.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.89 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6063  preprotein translocase, SecE subunit  40.68 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.962239  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  38.6 
 
 
89 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  47.83 
 
 
87 aa  44.3  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36.96 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0684  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000000414413  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  33.87 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  37.74 
 
 
80 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  32.2 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  38.78 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5108  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502951  normal  0.432233 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  44.68 
 
 
151 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 
85 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  42.59 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  34.48 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  37.04 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0740  preprotein translocase, SecE subunit  45.28 
 
 
125 aa  42  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 
66 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  32.73 
 
 
63 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 
136 aa  42  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 
59 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0567  SecE subunit of protein translocation complex  39.62 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0958  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  36.67 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.48 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 
72 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 
101 aa  41.2  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 
72 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
114 aa  40.8  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>