48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09680 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 144 aa  280  7.000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  44.83 
 
 		 126 aa  98.2  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2131  preprotein translocase, SecE subunit  68.85 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0325097  normal  0.788588 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 60 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  28.28 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  34.62 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  35.11 
 
 		 129 aa  47.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  34.07 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  34.04 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  29.76 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  36.17 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  42.55 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  38.46 
 
 		 51 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  36.17 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  38 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  26.25 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  36.96 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 59 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 161 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  37.78 
 
 		 81 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  39.13 
 
 		 63 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  33.96 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4357  preprotein translocase, SecE subunit  33.82 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  36 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  31.08 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0674  preprotein translocase, SecE subunit  39.47 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0712566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  32.08 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1320  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 		 76 aa  40  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  35.29 
 
 		 63 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>