44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2131 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2131  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 151 aa  287  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0325097  normal  0.788588 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  47.02 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09680  preprotein translocase, SecE subunit  47.74 
 
 		 144 aa  99.8  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00103622  hitchhiker  0.00000745581 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  30 
 
 		 158 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  31.58 
 
 		 120 aa  49.7  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  40.48 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  40.48 
 
 		 60 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 115 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  24.07 
 
 		 151 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  36.23 
 
 		 168 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  32.98 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  39.58 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  37.93 
 
 		 125 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  45.24 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  34.41 
 
 		 151 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  32.84 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  37.78 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  34.04 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  40.43 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  45.24 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  29.63 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  39.53 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  27.19 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  30.51 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 89 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  35 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  33.93 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2955  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 59 aa  40.4  0.008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  34.21 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 135 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  36.36 
 
 		 86 aa  40  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>