26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1176 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 		 60 aa  48.1  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  43.4 
 
 		 86 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  34.78 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  29.11 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 59 aa  42.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 63 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  34.69 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  35.94 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  34.33 
 
 		 78 aa  40  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>