15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1149 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 60 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1893  preprotein translocase subunit SecE  41.03 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0127051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2183  preprotein translocase subunit SecE  41.03 
 
 		 162 aa  43.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0165979  decreased coverage  0.00917802 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 		 123 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0194  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000062993  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2042  preprotein translocase subunit SecE  31.82 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000127265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  51.52 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  51.52 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  51.52 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  32.14 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  32.14 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  32.14 
 
 		 123 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>