13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3695 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 		 76 aa  146  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  41.3 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  29.09 
 
 		 115 aa  42.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 		 60 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  27.63 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.48 
 
 		 58 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  46.51 
 
 		 60 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 		 74 aa  40.8  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  35.59 
 
 		 72 aa  40  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>