83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0272 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0272  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 123 aa  243  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000196165  hitchhiker  0.00824344 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  48.05 
 
 		 80 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  66.1 
 
 		 79 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1931  preprotein translocase, SecE subunit  52.54 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000112962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0209  preprotein translocase subunit SecE  50.85 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000117834  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  55.74 
 
 		 122 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0404  preprotein translocase subunit SecE  56.9 
 
 		 72 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.88925e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2726  preprotein translocase, SecE subunit  44.23 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.200766  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 60 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  49.06 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0938  preprotein translocase subunit SecE  30.56 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  42.59 
 
 		 63 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  47.17 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0921  preprotein translocase subunit SecE  30.56 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.613648  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0949  preprotein translocase subunit SecE  30.56 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  43.55 
 
 		 62 aa  50.8  0.000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  28.97 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  45.45 
 
 		 80 aa  50.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  36.36 
 
 		 60 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6642  preprotein translocase, SecE subunit  32.98 
 
 		 136 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  35.48 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2723  preprotein translocase, SecE subunit  39.68 
 
 		 66 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0148464  normal  0.502256 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  36.76 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 59 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  31.25 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10651  preprotein translocase subunit SecE  36.07 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0332132 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 63 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  28.4 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 103 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  34.43 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 60 aa  44.3  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24000  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224762  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.18 
 
 		 115 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3694  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 		 62 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  42.55 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1817  preprotein translocase subunit SecE  39.62 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.723904  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  46.81 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  34.43 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  36.07 
 
 		 130 aa  42.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  34.43 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0408  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.58 
 
 		 122 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000649073  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  32.86 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  33.96 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3203  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 		 62 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  45.28 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0918  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.1 
 
 		 121 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000826277  hitchhiker  0.00000150404 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  45.28 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1149  preprotein translocase, SecE subunit  33.96 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257776  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2708  preprotein translocase subunit SecE  40.68 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0212735 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  40.38 
 
 		 73 aa  40.8  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  31.51 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  32.86 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  30.19 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  26.98 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  37.7 
 
 		 65 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  44.19 
 
 		 51 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0208  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.126547  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02261  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.227273  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  41.82 
 
 		 89 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  37.29 
 
 		 66 aa  40  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  35.38 
 
 		 122 aa  40  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4682  SecE subunit of protein translocation complex  28.79 
 
 		 86 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.0000391505  hitchhiker  0.00819357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 		 63 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>