13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1493 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1493  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
63 aa  125  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.394674  normal  0.332847 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0361  preprotein translocase, SecE subunit  38.98 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000000871663  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  31.67 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  34.55 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  35 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  32.79 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.93 
 
 
65 aa  42.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.29 
 
 
115 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2701  preprotein translocase subunit SecE  38 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  31.15 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  41.67 
 
 
60 aa  41.2  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2275  preprotein translocase subunit SecE  48.84 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.39962  normal  0.730245 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  30.51 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>