144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2787 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2787  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
77 aa  149  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  55.84 
 
 
82 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  59.09 
 
 
83 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  48 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  52.46 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  38.1 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  37.93 
 
 
60 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 
61 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  45.45 
 
 
61 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  45.83 
 
 
115 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  48.15 
 
 
79 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  51.16 
 
 
115 aa  50.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0306  preprotein translocase subunit SecE  53.49 
 
 
117 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000970626  normal  0.0458537 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  33.33 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1055  preprotein translocase subunit SecE  45.28 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.307784  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  42.31 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0831  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.74 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2202  preprotein translocase subunit SecE  36.21 
 
 
135 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00000000618681  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0445  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.172809  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  27.69 
 
 
73 aa  47.4  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4289  preprotein translocase, SecE subunit  47.06 
 
 
122 aa  47.8  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000573217  hitchhiker  0.00000222433 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  41.54 
 
 
73 aa  47.8  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 
63 aa  47.4  0.00008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0667  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
60 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.986958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
125 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  37.1 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 
131 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  35.71 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2113  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
135 aa  47  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307144  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0381  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  41.54 
 
 
73 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0356  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 
123 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  34.33 
 
 
81 aa  45.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  35.48 
 
 
60 aa  45.4  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1868  protein translocase subunit  47.62 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000227332  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0321  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 
127 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000345657  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  35.56 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2561  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.04 
 
 
65 aa  45.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0222073 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0304  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176051  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0753  preprotein translocase subunit SecE  51.43 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1022  preprotein translocase, SecE subunit  34.67 
 
 
78 aa  44.3  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0060109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0613  preprotein translocase subunit SecE  40.74 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000809702 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3903  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 
127 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1110  preprotein translocase, SecE subunit  36.84 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.103006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0252  preprotein translocase, SecE subunit  34.92 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310044  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  41.51 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
123 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3358  preprotein translocase, SecE subunit  37.04 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.234306 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4015  preprotein translocase subunit SecE  36.76 
 
 
83 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0367352  hitchhiker  0.00000028669 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03857  translocase  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000542011  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4014  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000048748  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03810  hypothetical protein  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00000544894  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3891  preprotein translocase subunit SecE  35.29 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00311904  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0282  SecE subunit of protein translocation complex  37.78 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000632695  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0347  preprotein translocase subunit SecE  34.48 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000107715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.04 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3252  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  35.19 
 
 
126 aa  43.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 
74 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1893  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.024176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01030  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.89094e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  37.04 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5446  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000383194  hitchhiker  0.0067856 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5118  preprotein translocase subunit SecE  40.48 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0191  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000178123  normal  0.246715 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3866  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  8.21747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4214  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  6.05954e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4520  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000132073  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0271  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179127  normal  0.0228965 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  40.82 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2804  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000191785  normal  0.0790705 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0333  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000137856  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4044  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000141034  hitchhiker  0.00697666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4429  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000053467  hitchhiker  0.0000280733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
123 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0368  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.611676  normal  0.774176 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4469  preprotein translocase subunit SecE  36 
 
 
127 aa  43.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000281914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  34.69 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>