75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01030  preprotein translocase, SecE subunit  100 
 
 
66 aa  130  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.89094e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0096  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
60 aa  51.2  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000178196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0179  preprotein translocase, SecE subunit  44.44 
 
 
63 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000000111498  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3163  preprotein translocase, SecE subunit  47.06 
 
 
87 aa  50.1  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.635579  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2869  preprotein translocase subunit SecE  39.34 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.07093  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 
130 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  38.71 
 
 
115 aa  48.9  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2474  preprotein translocase subunit SecE  38.1 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000284861  decreased coverage  0.000974181 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40 
 
 
86 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0640  preprotein translocase, SecE subunit  39.29 
 
 
62 aa  48.5  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000226614  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  43.4 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  36.84 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  37.5 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0092  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
60 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  47.92 
 
 
125 aa  47.8  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  40.98 
 
 
82 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0105  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.53288e-62 
 
 
-
 
NC_002936  DET0995  preprotein translocase subunit SecE  47.92 
 
 
72 aa  47  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000327583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0125  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000332702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0095  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000231467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0095  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000184804  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0091  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
63 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.58206e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0089.1  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000332974  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0095  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000233788  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5211  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000209683  unclonable  2.82699e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0115  preprotein translocase subunit SecE  43.4 
 
 
59 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000539908  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_867  preprotein translocase SecE subunit  47.92 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000768713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0853  preprotein translocase, SecE subunit  47.62 
 
 
51 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000244118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0089  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
59 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000139585  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  32.79 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1449  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 
83 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2348  preprotein translocase subunit SecE  38.89 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00842063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0536  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310096  hitchhiker  0.00455289 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  31.03 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2990  preprotein translocase subunit SecE  37.74 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0572  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000919573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0558  preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 
60 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00292414  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  31.67 
 
 
63 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0090  preprotein translocase subunit SecE  41.51 
 
 
59 aa  45.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1513  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 
60 aa  44.7  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000908707  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0886  preprotein translocase subunit SecE  45.83 
 
 
72 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00409915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  33.33 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  31.67 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  35.48 
 
 
89 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0176  preprotein translocase subunit SecE  38.3 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.103844  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3341  preprotein translocase subunit SecE  38.33 
 
 
61 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101417 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
187 aa  42.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0920  preprotein translocase subunit SecE  38.98 
 
 
61 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  36.73 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1233  preprotein translocase subunit SecE  37.25 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.293641 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  42.55 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  35.09 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2996  preprotein translocase subunit SecE  46 
 
 
107 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2787  preprotein translocase, SecE subunit  47.17 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303103  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  32.76 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  36 
 
 
168 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03620  preprotein translocase, SecE subunit  36.54 
 
 
151 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  30.19 
 
 
59 aa  41.6  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1176  preprotein translocase, SecE subunit  30.77 
 
 
120 aa  41.6  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000187146  unclonable  0.0000000215336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08680  preprotein translocase, SecE subunit  34.55 
 
 
126 aa  42  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000111106  hitchhiker  0.0000000182665 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  40.74 
 
 
92 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 
76 aa  41.2  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0445  preprotein translocase subunit SecE  37.5 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0201  preprotein translocase subunit SecE  45.1 
 
 
122 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000633363  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  40.43 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  29.09 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  30 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1026  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0688  putative SecE preprotein translocase subunit  39.62 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.8362399999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>