24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2414 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_2414  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 74 aa  145  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000000338556  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2728  preprotein translocase subunit SecE  98.65 
 
 		 74 aa  143  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000036945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2168  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  32.84 
 
 		 86 aa  53.5  0.0000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.124432  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4021  preprotein translocase, SecE subunit  35.38 
 
 		 123 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.962383  normal  0.504594 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1182  preprotein translocase subunit SecE  32.31 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00132443  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2688  preprotein translocase, SecE subunit  30.56 
 
 		 73 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00149434  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  35.19 
 
 		 89 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0306  preprotein translocase, SecE subunit  33.87 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000630488  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2550  preprotein translocase subunit SecE  32.31 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000058162  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1042  preprotein translocase subunit SecE  30.91 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000810239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2227  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323574 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0644  preprotein translocase subunit SecE  29.31 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.243219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3695  preprotein translocase, SecE subunit  41.3 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000548448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  27.42 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  33.33 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  30.56 
 
 		 89 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1630  preprotein translocase subunit SecE  27.27 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01030  preprotein translocase, SecE subunit  43.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.89094e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1333  preprotein translocase subunit SecE  41.07 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0318216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1012  preprotein translocase, SecE subunit  36.36 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1321  preprotein translocase, SecE subunit  32.08 
 
 		 187 aa  41.2  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0267  preprotein translocase subunit SecE  28.79 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00826635  normal  0.0562332 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0636  preprotein translocase subunit SecE  28.57 
 
 		 81 aa  40.8  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0204461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  27.78 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>