76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0351 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0351  preprotein translocase subunit SecE  100 
 
 		 63 aa  124  4.0000000000000003e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000092456  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1968  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 		 63 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.51744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0227  preprotein translocase subunit SecE  85.71 
 
 		 63 aa  107  5e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0635972  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2685  preprotein translocase subunit SecE  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176795  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0190  preprotein translocase subunit SecE  80.95 
 
 		 63 aa  106  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000126022  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0313  preprotein translocase subunit SecE  65.08 
 
 		 63 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000123291  decreased coverage  0.0000997668 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0282  preprotein translocase subunit SecE  60.32 
 
 		 63 aa  82.4  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000000441013  hitchhiker  0.00342924 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1102  preprotein translocase, SecE subunit  45.61 
 
 		 62 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000145064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0120  preprotein translocase, SecE subunit  40 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.568104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0908  preprotein translocase subunit SecE  43.1 
 
 		 89 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.147165  normal  0.167363 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0187  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000823053  hitchhiker  0.000548476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4069  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000432284  hitchhiker  0.00908786 
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4469  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0183  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 123 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000000157083  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000112124  normal  0.0180264 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3772  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452492  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0186  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000826672  hitchhiker  0.00751304 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0181  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 123 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000171  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1533  preprotein translocase, SecE subunit  36.21 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000234675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0849  preprotein translocase, SecE subunit  35.59 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235049  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4330  preprotein translocase subunit SecE  46.67 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000313064  hitchhiker  0.00000000188244 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0218  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 123 aa  46.2  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4703  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 123 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000037355  hitchhiker  0.00000444162 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3324  preprotein translocase, SecE subunit  48.84 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139323  normal  0.104735 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4322  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0468  preprotein translocase, SecE subunit  28.07 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000605579  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0696  preprotein translocase, SecE subunit  39.62 
 
 		 130 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00247694  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0483  preprotein translocase, SecE subunit  28.07 
 
 		 65 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000407474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0135  preprotein translocase subunit SecE  39.22 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000169097  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2718  preprotein translocase, SecE subunit  38.3 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00287397  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002167  preprotein translocase subunit SecE  43.64 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000092259  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2724  preprotein translocase subunit SecE  44.9 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108515  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1543  preprotein translocase, SecE subunit  42.55 
 
 		 115 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.273014  normal  0.520418 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0145  preprotein translocase subunit SecE  50 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000598149  normal  0.0330046 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0238  preprotein translocase, SecE subunit  41.51 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0267  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.89 
 
 		 58 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0300363  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0484  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00122537  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2872b  preprotein translocase subunit SecE  42 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00131077  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0313  preprotein translocase, SecE subunit  35.85 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.663429  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00231  preprotein translocase subunit SecE  41.82 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1825  preprotein translocase, SecE subunit  35.09 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1067  hypothetical protein  45.65 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.882729 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3873  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 127 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29890  preprotein translocase, SecE subunit  33.87 
 
 		 92 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.449965 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0522  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 		 59 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.140094  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0684  preprotein translocase, SecE subunit  32.61 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.000000414413  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1462  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 		 59 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000123157  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0502  preprotein translocase subunit SecE  29.63 
 
 		 59 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000175408  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0559  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  37.04 
 
 		 63 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0266  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00308098  hitchhiker  0.00137847 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0834  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  38.18 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00337314  normal  0.0903052 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1060  preprotein translocase, SecE subunit  35.19 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168917  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3452  preprotein translocase, SecE subunit  40.82 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.0121626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4331  preprotein translocase, SecE subunit  45.95 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.673336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3195  preprotein translocase subunit SecE  41.27 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0644038  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17310  protein translocase subunit secE/sec61 gamma  40.35 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0741  preprotein translocase, SecE subunit  32.73 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0155553 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0171  preprotein translocase subunit SecE  40 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000158213  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0157  preprotein translocase subunit SecE  42.86 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000628053  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3320  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.160512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00689  Preprotein translocase subunit SecE  35.85 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000478021  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1669  preprotein translocase subunit SecE  38.46 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00942415  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0200  preprotein translocase subunit SecE  44.44 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185504  hitchhiker  0.0000981589 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2973  preprotein translocase subunit SecE  40.35 
 
 		 126 aa  40.8  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0258  preprotein translocase, SecE subunit  36.17 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3433  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00023001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0313  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000158246  normal  0.139 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0262  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000233394  normal  0.439523 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2773  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.101762  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0253  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0223726  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0334  preprotein translocase subunit SecE  39.29 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000349091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1445  SecE subunit of protein translocation complex  35.71 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.716956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2078  preprotein translocase, SecE subunit  32.2 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0293  preprotein translocase subunit SecE  32.76 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.970466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0592  preprotein translocase, SecE subunit  37.78 
 
 		 125 aa  40  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000922511  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0610  preprotein translocase, SecE subunit  42 
 
 		 84 aa  40  0.01  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>