More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0083 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0083  ABC transporter related  100 
 
 		 212 aa  434  1e-121  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.599688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  52.15 
 
 		 221 aa  232  3e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.31196  normal  0.583973 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21600  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  48.57 
 
 		 214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0852  ABC transporter related protein  44.65 
 
 		 240 aa  175  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1582  ABC transporter related protein  43.87 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.217269  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3176  ABC transporter related protein  48.77 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1589  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11191  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2811  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 223 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179867  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3083  ABC transporter, ATP-binding protein  38.92 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.760416  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4849  ABC transporter related  39.44 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2837  ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000357321  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2771  ABC transporter, ATP-binding protein  35.81 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3052  ABC transporter ATP-binding protein  36.28 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3064  ABC transporter, ATP-binding protein  38.35 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2170  ABC transporter related  37.5 
 
 		 247 aa  142  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 221 aa  142  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  38.05 
 
 		 226 aa  141  8e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1296  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.6 
 
 		 647 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3081  ABC transporter, ATP-binding protein  37.86 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.501337  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  39.79 
 
 		 233 aa  139  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  39.38 
 
 		 253 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1029  ABC transporter related  37.56 
 
 		 276 aa  139  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0752137 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  40.64 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  40.64 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2955  ABC transporter related  39.8 
 
 		 250 aa  138  6e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.176786 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2280  ABC transporter, ATP-binding protein  41.94 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0760186 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1739  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.81 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3482  ABC transporter related protein  42.27 
 
 		 237 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.782021  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  40 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  38.12 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  41.04 
 
 		 260 aa  136  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2990  hypothetical protein  39.69 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2850  hypothetical protein  39.69 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0681  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 		 222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.614663 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0081  ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 		 240 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.00000000000000360668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  34.45 
 
 		 225 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0573  ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2860  ABC transporter-like  36.79 
 
 		 224 aa  135  4e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.496256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2870  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  38.5 
 
 		 663 aa  135  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.876991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  36.36 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2406  ABC transporter related  39.79 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33760  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  38.5 
 
 		 663 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.267667  hitchhiker  0.000629117 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.76 
 
 		 247 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  38.22 
 
 		 241 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  39.23 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  36.57 
 
 		 234 aa  134  7.000000000000001e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0833  ABC transporter related  34.91 
 
 		 224 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  39.09 
 
 		 228 aa  134  9e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  38.5 
 
 		 226 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0085  ABC transporter related  38.86 
 
 		 235 aa  134  9e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 246 aa  134  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  41.76 
 
 		 222 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  36.1 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1839  ABC transporter related  38.14 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.411492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.59 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  34.63 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  33.5 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3521  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.329069  normal  0.185776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  33.97 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 249 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  34.58 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  38.8 
 
 		 408 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07200  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.05 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.408967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0331  peptide ABC transporter ATPase  37.56 
 
 		 662 aa  133  1.9999999999999998e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0848713  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.38 
 
 		 253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  35.12 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  37.5 
 
 		 235 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 252 aa  132  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3778  ABC transporter related  39.9 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.691965  normal  0.46776 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0205  ABC transporter related  38.68 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2610  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.15 
 
 		 649 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  37.31 
 
 		 263 aa  133  3e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1671  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  38.21 
 
 		 648 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.942094 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3558  ABC transporter related  36.79 
 
 		 653 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.906345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2695  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  39.15 
 
 		 649 aa  132  3e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3474  ABC transporter related  37.69 
 
 		 655 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3983  ABC transporter related  39.51 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  37.63 
 
 		 230 aa  132  5e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  37.68 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1377  ABC transporter related  40.19 
 
 		 232 aa  132  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.757456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 231 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  38.5 
 
 		 654 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2431  ABC transporter related  38.95 
 
 		 246 aa  131  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000823093  decreased coverage  0.000192607 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0038  ABC transporter ATP-binding protein  36.62 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0199  ABC transporter related  37.68 
 
 		 291 aa  131  7.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.500002  normal  0.26855 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6963  ABC transporter related  36.95 
 
 		 291 aa  131  9e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0488455  normal  0.63897 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  39.2 
 
 		 252 aa  130  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0573  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  40.91 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00451  hypothetical protein  40.91 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2566  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.92 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0799342  normal  0.05105 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0534  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  40.91 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  38.34 
 
 		 246 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3121  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbA  40.91 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114112 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  36.45 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>