More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_0697 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_0697  transketoloase, C half  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.837924  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1589  transketolase family protein  70.19 
 
 		 288 aa  165  2e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3397  Transketolase central region  51 
 
 		 298 aa  103  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5637  transketolase subunit B  43.27 
 
 		 307 aa  100  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2287  transketolase central region  46.46 
 
 		 305 aa  93.6  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3642  Transketolase central region  48.89 
 
 		 307 aa  89.7  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14551  transketolase C-terminal subunit  37.5 
 
 		 304 aa  89.7  1e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3528  Transketolase central region  46.67 
 
 		 306 aa  87.8  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.605284  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5103  Transketolase central region  43.88 
 
 		 306 aa  80.1  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.47717 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1130  transketolase central region  45.98 
 
 		 336 aa  79  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2126  Transketolase domain protein  41.84 
 
 		 320 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1505  transketolase central region  41.76 
 
 		 314 aa  77  0.00000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0385912  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2213  transketolase subunit B  43.68 
 
 		 317 aa  77  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000528401  hitchhiker  0.000741425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3382  transketolase domain-containing protein  42.53 
 
 		 314 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0796  Transketolase central region  37.86 
 
 		 316 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0881  Transketolase central region  44.83 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000000876605  normal  0.0478781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0910  putative transketolase, C-terminal subunit  41.38 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3248  putative transketolase, C-terminal subunit  41.38 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2402  transketolase, C-terminal subunit  41.38 
 
 		 310 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.730568  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0180  transketolase, central region  35.05 
 
 		 162 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0365  transketolase central region  41.76 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.556876  normal  0.0129681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6362  Transketolase central region  38.38 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.465513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1554  transketolase central region  41.76 
 
 		 312 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0600642  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0471  transketolase subunit B  41.76 
 
 		 312 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0285277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0244  transketolase-like protein  41.76 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0438  transketolase central region  40.66 
 
 		 312 aa  70.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0397028  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2800  Transketolase central region  38.71 
 
 		 320 aa  70.9  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2032  Transketolase domain protein  42.27 
 
 		 318 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.262756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0614  transketolase, central region  38.24 
 
 		 310 aa  70.9  0.000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.593318 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2254  Transketolase domain protein  42.27 
 
 		 318 aa  70.5  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.655402  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1058  transketolase subunit B  39.58 
 
 		 308 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2646  Transketolase domain protein  37.93 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0477221  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1192  transketolase-like  38.89 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.101787  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5715  Transketolase central region  40 
 
 		 296 aa  68.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1178  Transketolase central region  40.23 
 
 		 327 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0058066  normal  0.0131189 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2444  transketolase subunit B  38.61 
 
 		 313 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1273  transketolase central region  31.73 
 
 		 303 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.257757  hitchhiker  0.0057855 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3967  Transketolase central region  42.86 
 
 		 313 aa  68.2  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000645501  unclonable  0.000000000133165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1170  transketolase subunit B  38.89 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000103125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0293  putative transketolase, C-terminal subunit  37.04 
 
 		 314 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0288  transketolase  37.04 
 
 		 314 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000211069  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0244  Transketolase central region  38.24 
 
 		 305 aa  67.4  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.304733  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0237  transketolase subunit B  39.56 
 
 		 311 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1286  transketolase-like  40.23 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.290354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4986  transketolase central region  37.65 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.545662  hitchhiker  0.000179953 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0711  Transketolase central region  39.08 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000202012  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0173  Transketolase central region  38.64 
 
 		 313 aa  65.5  0.0000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4473  transketolase, central region  31.73 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0113424 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2513  transketolase subunit B  38.3 
 
 		 322 aa  65.1  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6295  Transketolase central region  39.18 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0874  Transketolase central region  37.78 
 
 		 326 aa  65.5  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1381  Transketolase central region  36.26 
 
 		 306 aa  65.5  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1277  Transketolase central region  40.82 
 
 		 313 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0407  transketolase central region  37.11 
 
 		 323 aa  64.7  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0194561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0049  transketolase, central region  36.67 
 
 		 317 aa  64.3  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1173  Transketolase central region  36.67 
 
 		 327 aa  64.3  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000393635  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0492  transketolase, central region  40.66 
 
 		 312 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4002  Transketolase central region  33.33 
 
 		 299 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.226763  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0809  transketolase central region  37.36 
 
 		 592 aa  63.5  0.0000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.32467  normal  0.55266 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0334  Transketolase central region  34.74 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0280  Transketolase central region  40.66 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0333  Transketolase central region  35.51 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0265  Transketolase central region  40.66 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214892 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0873  Transketolase central region  36.67 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.199119  hitchhiker  0.00317558 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4834  transketolase central region  37.08 
 
 		 333 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1878  transketolase subunit B  39.22 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0969  transketolase, central region  39.08 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86113  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0789  transketolase central region  41.38 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1775  transketolase, central region  42.53 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2110  transketolase, central region  41.38 
 
 		 314 aa  61.2  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.44874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1860  Transketolase central region  36.78 
 
 		 321 aa  60.8  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05490  transketolase subunit B  37.5 
 
 		 325 aa  60.5  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.948034 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1628  transketolase, C-terminal subunit  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.750747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2655  transketolase, C-terminal subunit  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1923  transketolase domain-containing protein  36.17 
 
 		 315 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2568  transketolase domain-containing protein  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2515  transketolase domain-containing protein  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1404  transketolase, C-terminal subunit  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.108594  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2130  transketolase, C-terminal subunit  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.963697  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3184  transketolase, C-terminal subunit  34.41 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0894  transketolase subunit B  43.75 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3129  transketolase domain-containing protein  37.11 
 
 		 322 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1963  transketolase, C-terminal subunit  34.41 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.686485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3878  transketolase, central region  35.96 
 
 		 342 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2448  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  38.38 
 
 		 631 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09040  transketolase subunit B  34.94 
 
 		 315 aa  58.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.28283  normal  0.0525296 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1997  Transketolase central region  34.94 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329881 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2689  transketolase domain-containing protein  34.44 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2481  transketolase domain protein  34.44 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.120495  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4663  transketolase central region  35.11 
 
 		 328 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00875  transketolase, C-terminal subunit  32.22 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2526  transketolase domain protein  34.44 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2581  transketolase domain-containing protein  34.44 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.230809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2569  transketolase domain protein  34.44 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.126502  normal  0.742091 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2059  Transketolase central region  36.56 
 
 		 313 aa  58.2  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0200  transketolase, C-terminal subunit  34.52 
 
 		 309 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1078  deoxyxylulose-5-phosphate synthase  37.37 
 
 		 635 aa  57.4  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0303047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1895  transketolase, C-terminal subunit  33.33 
 
 		 318 aa  57.4  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00759771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0183  Transketolase central region  33.33 
 
 		 320 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3074  transketolase, central region  41.38 
 
 		 313 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289222  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>