More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2694 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
450 aa  869    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  38.3 
 
 
463 aa  208  2e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  43.86 
 
 
431 aa  201  3e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  37.38 
 
 
415 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  38.87 
 
 
432 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0609  Pyrrolo-quinoline quinone  36.29 
 
 
352 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.471438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  36.7 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  35.5 
 
 
963 aa  158  2e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 
687 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  36.7 
 
 
423 aa  149  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  39.78 
 
 
795 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 
652 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  35.12 
 
 
653 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  34.98 
 
 
774 aa  143  8e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  38.38 
 
 
1454 aa  135  9.999999999999999e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  30 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  34.66 
 
 
484 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  31.85 
 
 
514 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  35.34 
 
 
457 aa  117  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
1383 aa  111  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  32.66 
 
 
324 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  31.81 
 
 
2036 aa  106  9e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  31.81 
 
 
1969 aa  106  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  29.28 
 
 
374 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  27.21 
 
 
809 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  32.63 
 
 
382 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  31.06 
 
 
1812 aa  100  5e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  32.39 
 
 
901 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0659  Pyrrolo-quinoline quinone  32.34 
 
 
322 aa  99.8  9e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4961  Pyrrolo-quinoline quinone  35.64 
 
 
440 aa  99.4  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.559065 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.06 
 
 
2272 aa  99  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  29.66 
 
 
1328 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1446  Pyrrolo-quinoline quinone  30.52 
 
 
412 aa  98.2  3e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  28.85 
 
 
1241 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  31.49 
 
 
1682 aa  97.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0401  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 
469 aa  97.1  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.448913  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  28.53 
 
 
556 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  30.97 
 
 
322 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  31.6 
 
 
322 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1009  Pyrrolo-quinoline quinone beta-propeller repeat protein  36.36 
 
 
438 aa  96.3  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1041  PQQ repeat-containing protein  32.17 
 
 
371 aa  94  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0499  Pyrrolo-quinoline quinone  33.22 
 
 
439 aa  93.2  9e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6658  metallophosphoesterase  28.76 
 
 
616 aa  92.8  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.492609 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_911  PQQ enzyme repeat domain protein  31.3 
 
 
371 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00179441  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  30.9 
 
 
397 aa  91.7  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0923  Pyrrolo-quinoline quinone  31 
 
 
371 aa  92  2e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00190176  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  31.5 
 
 
486 aa  92  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  27.96 
 
 
611 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2473  Pyrrolo-quinoline quinone  31.96 
 
 
455 aa  90.5  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31 
 
 
1300 aa  88.2  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1290  Pyrrolo-quinoline quinone  27.94 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.366106  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2941  Pyrrolo-quinoline quinone  26.13 
 
 
396 aa  87.8  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.324041  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  28.88 
 
 
475 aa  86.7  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  26.81 
 
 
399 aa  86.7  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  28.45 
 
 
797 aa  86.7  9e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  31.68 
 
 
2122 aa  85.9  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  34.2 
 
 
497 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000000580169  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 
363 aa  85.1  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  31.25 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1270  Pyrrolo-quinoline quinone  29.34 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  31.62 
 
 
363 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3214  Pyrrolo-quinoline quinone  30.23 
 
 
349 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000613548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2153  Pyrrolo-quinoline quinone  29.6 
 
 
365 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.75992  normal  0.0359383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  28.35 
 
 
422 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  29.25 
 
 
445 aa  81.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  26.58 
 
 
619 aa  81.3  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3412  Pyrrolo-quinoline quinone  27.84 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  30.24 
 
 
422 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2056  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 
705 aa  78.6  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9756  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  27.51 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  27.51 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1091  Pyrrolo-quinoline quinone  27.12 
 
 
402 aa  77.4  0.0000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0160  Pyrrolo-quinoline quinone  27.7 
 
 
471 aa  77  0.0000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0726185  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  27.87 
 
 
1311 aa  75.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1964  Pyrrolo-quinoline quinone  30.38 
 
 
834 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00278286  hitchhiker  0.000521306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1661  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.87 
 
 
402 aa  75.5  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.274941 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.27 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.55 
 
 
411 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  29.39 
 
 
392 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1531  Pyrrolo-quinoline quinone  31.78 
 
 
546 aa  74.7  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.497288  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3015  Pyrrolo-quinoline quinone  29.84 
 
 
416 aa  74.3  0.000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  29.39 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  27.59 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.77 
 
 
407 aa  73.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  28.98 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.98 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000327746  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.98 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000117492  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  28.98 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.98 
 
 
392 aa  73.2  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.98 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.98 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3123  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  26.43 
 
 
415 aa  72.8  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.126817  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  28.81 
 
 
1067 aa  72.4  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1776  serine/threonine protein kinase  25.91 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.801728  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1608  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  26.04 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0821312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1936  PQQ enzyme repeat domain protein  26.04 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.95 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  27.95 
 
 
393 aa  71.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  28.62 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
611 aa  70.9  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>