234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1249 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_1249  putative RNA methylase  100 
 
 		 343 aa  666    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0722  putative RNA methylase  61.7 
 
 		 334 aa  365  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0132  putative RNA methylase  58.42 
 
 		 371 aa  355  5e-97  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1864  putative RNA methylase  54.25 
 
 		 365 aa  309  5e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.382861  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2630  putative RNA methylase  54.7 
 
 		 356 aa  288  8e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1330  N2-methylguanosine tRNA methyltransferase  34.39 
 
 		 355 aa  171  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.315731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1623  putative RNA methylase  31.17 
 
 		 344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.236365  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2321  putative RNA methylase  37.01 
 
 		 318 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.334147  normal  0.512947 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0420  hypothetical protein  33.91 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0587292 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1006  putative RNA methylase  34.75 
 
 		 346 aa  157  4e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0125  putative RNA methylase  32.56 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1059  putative RNA methylase  35.17 
 
 		 317 aa  146  6e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.0000310515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1210  putative RNA methylase  31.23 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00394731 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0801  putative RNA methylase  28.11 
 
 		 351 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1154  putative RNA methylase  26.79 
 
 		 364 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1526  putative RNA methylase  27.37 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1149  putative RNA methylase  27.76 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0482589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0103  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.802972  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1775  putative RNA methylase  31.9 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0667  putative RNA methylase  22.75 
 
 		 367 aa  86.7  6e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.107618  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1789  putative RNA methylase  36.7 
 
 		 304 aa  85.9  8e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0700  putative RNA methylase  30.98 
 
 		 374 aa  82.8  0.000000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.46275  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2015  putative RNA methylase  29.55 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.128985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0852  hypothetical protein  31.58 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0801  methyltransferase  31.58 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0899  hypothetical protein  31.58 
 
 		 284 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000386994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0987  hypothetical protein  31.58 
 
 		 297 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.86692e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4390  hypothetical protein  31.58 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.043324  unclonable  2.45562e-26 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  50.56 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0941  hypothetical protein  31.58 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00258982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1080  hypothetical protein  30.92 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.118177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0793  putative RNA methylase  30.92 
 
 		 317 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.314828  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0592  putative RNA methylase  39.52 
 
 		 225 aa  66.2  0.0000000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0985  hypothetical protein  29.33 
 
 		 284 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0179865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0797  methyltransferase  28.48 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.212906  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37849  predicted protein  32.46 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00619482  hitchhiker  0.00164206 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  41.57 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 260 aa  57  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3456  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.89 
 
 		 449 aa  56.2  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0686  putative RNA methylase  36 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.502689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1254  putative RNA methylase  26.69 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  decreased coverage  0.00904523  normal  0.667506 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0509  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1582  putative RNA methylase  34.4 
 
 		 357 aa  53.9  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 255 aa  53.1  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0938  putative RNA methylase  44.9 
 
 		 461 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000152524  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0555  putative RNA methylase  32.35 
 
 		 336 aa  52.4  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0408  putative RNA methylase  23.4 
 
 		 334 aa  52.4  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  33.91 
 
 		 504 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45681  predicted protein  31.62 
 
 		 591 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.27 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.27 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  35.92 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4223  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.36 
 
 		 947 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0211  putative methyltransferase  31.36 
 
 		 183 aa  51.2  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.785474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  29.27 
 
 		 463 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0371274  normal  0.891306 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  41.46 
 
 		 234 aa  50.8  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 284 aa  51.2  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1720  putative RNA methylase  23.95 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0118315  decreased coverage  0.000010347 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0793  hypothetical protein  28.81 
 
 		 182 aa  50.1  0.00005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.290865  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  39.2 
 
 		 698 aa  50.1  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  41.77 
 
 		 255 aa  49.7  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 259 aa  49.3  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1354  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.26 
 
 		 445 aa  49.3  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.961347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  32.11 
 
 		 240 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1286  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  24.16 
 
 		 442 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0270354  unclonable  0.00000000011365 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  38.26 
 
 		 262 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  43.66 
 
 		 235 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.97 
 
 		 239 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000221573  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  33.04 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  43.06 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  40.24 
 
 		 248 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  30.34 
 
 		 663 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.57 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 200 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3585  putative RNA methylase  28.95 
 
 		 352 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.626531  hitchhiker  0.0000715951 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3056  type I restriction-modification system, M subunit  26.81 
 
 		 515 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.994596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1527  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.03 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.334033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1470  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.03 
 
 		 468 aa  47.8  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00598904  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1100  putative RNA methylase  25.21 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  30.91 
 
 		 444 aa  47.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  43.21 
 
 		 233 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0857  protein of unknown function Met10  31.03 
 
 		 381 aa  47.4  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.149196  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1659  putative RNA methylase  34.34 
 
 		 224 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.69991  hitchhiker  0.00475931 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39 
 
 		 232 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.530089  normal  0.587198 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1984  putative RNA methylase  34.07 
 
 		 227 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11434  methyltransferase  35.06 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00184811  normal  0.364084 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03100  sterol 24-C-methyltransferase, putative  34.65 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0399554  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50882  predicted protein  28.83 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.933008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  40.85 
 
 		 251 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0968  methyltransferase small  36.78 
 
 		 392 aa  46.6  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 276 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.71 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.71 
 
 		 241 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  30.65 
 
 		 499 aa  46.6  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.94 
 
 		 243 aa  46.6  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>