115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4632 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  100 
 
 		 380 aa  772    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  75.79 
 
 		 380 aa  595  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  53.19 
 
 		 369 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  34.46 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  35.81 
 
 		 373 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  37.58 
 
 		 394 aa  193  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  37.08 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  33.6 
 
 		 380 aa  185  1.0000000000000001e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  31.65 
 
 		 372 aa  162  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  30.4 
 
 		 407 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  32.85 
 
 		 416 aa  155  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  31.6 
 
 		 309 aa  139  7e-32  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  24.52 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.11 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  22.53 
 
 		 291 aa  58.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  26.98 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  24.22 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  23.7 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  21.89 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.06 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  23.04 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.14 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.08 
 
 		 300 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.83 
 
 		 296 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1455  integrase family protein  24.08 
 
 		 365 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.34 
 
 		 297 aa  53.5  0.000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.67 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  20.34 
 
 		 299 aa  53.1  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  38.82 
 
 		 292 aa  53.1  0.000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4505  hypothetical protein  50 
 
 		 206 aa  53.1  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  30.95 
 
 		 306 aa  52.8  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  24.11 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  24.03 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  28.57 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 295 aa  51.6  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.49 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  24.11 
 
 		 305 aa  52  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.48 
 
 		 311 aa  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.43 
 
 		 300 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  25.66 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.88 
 
 		 330 aa  50.8  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  23.6 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  23.6 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.59 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.12 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  25.62 
 
 		 304 aa  50.4  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  21.34 
 
 		 336 aa  50.1  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.08 
 
 		 294 aa  50.1  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.99 
 
 		 303 aa  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.26 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  29.61 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0669  integrase-recombinase  19.7 
 
 		 311 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.53 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  23.85 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  22.22 
 
 		 307 aa  47.4  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  23.51 
 
 		 308 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.71 
 
 		 298 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 304 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  23.36 
 
 		 299 aa  47  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0234  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.35 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.18 
 
 		 315 aa  46.6  0.0007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2375  hypothetical protein  34.85 
 
 		 258 aa  46.6  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0078  phage integrase family protein  21.26 
 
 		 319 aa  46.2  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  19.78 
 
 		 384 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  24.42 
 
 		 304 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  23.86 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1900  phage integrase family protein  25.74 
 
 		 331 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.125862  hitchhiker  0.00365877 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5937  phage integrase family protein  33.91 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.86 
 
 		 300 aa  45.8  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.45 
 
 		 336 aa  45.8  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014000  Ava_D0026  Phage integrase  26.92 
 
 		 309 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  20.41 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.7 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  23.11 
 
 		 291 aa  45.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 317 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  26.63 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3973  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.68 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.556004  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  25 
 
 		 324 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.35 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  21.95 
 
 		 294 aa  44.7  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  21.88 
 
 		 321 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  23.39 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_013163  Cyan8802_4591  integrase family protein  26.13 
 
 		 316 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000000427706  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.17 
 
 		 294 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  24.88 
 
 		 296 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>