33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_4009 on replicon NC_013924
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  100 
 
 		 373 aa  759    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  54.86 
 
 		 380 aa  393  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  41.01 
 
 		 379 aa  266  5.999999999999999e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  37.77 
 
 		 369 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  37.94 
 
 		 407 aa  206  4e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  35 
 
 		 380 aa  203  5e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  39.35 
 
 		 394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  35.81 
 
 		 380 aa  197  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  36.16 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  37.34 
 
 		 372 aa  196  8.000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  35.38 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  36.96 
 
 		 309 aa  179  4.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.19 
 
 		 294 aa  55.8  0.000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.61 
 
 		 277 aa  52.8  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.25 
 
 		 429 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.76 
 
 		 305 aa  49.7  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  24.2 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0315  30S ribosomal protein S15  21.97 
 
 		 406 aa  47.8  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00992142  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 304 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  28.37 
 
 		 304 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_63  site-specific recombinase, phage integrase family  23.67 
 
 		 332 aa  46.6  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  24.65 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  21.5 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  26.7 
 
 		 324 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  25 
 
 		 307 aa  44.7  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  27.96 
 
 		 242 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  28.15 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  22.03 
 
 		 390 aa  43.1  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3691  site-specific integrase  21.85 
 
 		 370 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.95 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  21.59 
 
 		 369 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  22.95 
 
 		 374 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>