75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5046 on replicon NC_013748
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013748  Htur_5046  integrase family protein  100 
 
 		 369 aa  752    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4632  integrase family protein  53.19 
 
 		 380 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4861  integrase family protein  50.27 
 
 		 380 aa  340  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4009  integrase family protein  37.77 
 
 		 373 aa  234  2.0000000000000002e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3444  Site-specific recombinase XerD-like protein  39.88 
 
 		 403 aa  209  5e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.862055  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5150  Site-specific recombinase XerD-like protein  40.37 
 
 		 394 aa  207  3e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.238574  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3240  integrase family protein  33.96 
 
 		 380 aa  202  8e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4353  hypothetical protein  33.33 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947426  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3395  hypothetical protein  31.95 
 
 		 416 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2941  site-specific recombinase  31.42 
 
 		 407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3317  hypothetical protein  33.63 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.802831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3406  site-specific recombinase  33.22 
 
 		 309 aa  137  2e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  22.77 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  23.27 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  25.49 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3445  integrase family protein  27.41 
 
 		 304 aa  52.8  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  25.19 
 
 		 332 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  21.54 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  22.74 
 
 		 297 aa  51.6  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.46 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  22.02 
 
 		 306 aa  50.4  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 298 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  21.66 
 
 		 306 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  23.51 
 
 		 349 aa  50.1  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.96 
 
 		 311 aa  50.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.86 
 
 		 294 aa  49.7  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  23.74 
 
 		 296 aa  49.7  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3587  integrase family protein  27.18 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  decreased coverage  0.00000000515843  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8114  integrase/recombinase  36.26 
 
 		 408 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200175  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.24 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  24.93 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.24 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  22.22 
 
 		 310 aa  47.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.55 
 
 		 294 aa  47.4  0.0004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.18 
 
 		 277 aa  47.4  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4505  hypothetical protein  39.29 
 
 		 206 aa  47  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  24.48 
 
 		 294 aa  46.6  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  24.23 
 
 		 294 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  25.76 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0423  integrase family protein  30.65 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  25.81 
 
 		 343 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  25.82 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0370  phage integrase family protein  20.65 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.05 
 
 		 299 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.36 
 
 		 391 aa  44.7  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.07 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2230  integrase family protein  25.95 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3507  phage integrase family protein  32.18 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.646395  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  22.25 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5350  integrase family protein  25.95 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.467969 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2006  integrase family protein  25.95 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  24.1 
 
 		 298 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  24.19 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03202  phage integrase  28.18 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000402051  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  23.68 
 
 		 298 aa  43.9  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.58 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  20.85 
 
 		 291 aa  43.1  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2967  hypothetical protein  24.39 
 
 		 534 aa  43.1  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.94 
 
 		 300 aa  42.7  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0047  tyrosine recombinase XerC  23.69 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  21.53 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  21.53 
 
 		 295 aa  42.7  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  37.5 
 
 		 336 aa  42.7  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.92 
 
 		 296 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>