173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2397 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2397  nitroreductase  100 
 
 
205 aa  415  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1442  nitroreductase  60.53 
 
 
195 aa  239  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1391  nitroreductase  51.81 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1300  nitroreductase  51.3 
 
 
197 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1566  nitroreductase  52.11 
 
 
197 aa  193  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00494476 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3919  nitroreductase family protein  52.11 
 
 
197 aa  193  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4118  nitroreductase  50.78 
 
 
197 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4588  nitroreductase  50.78 
 
 
197 aa  192  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1538  nitroreductase  49.74 
 
 
203 aa  188  5e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.422269 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5063  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  48.7 
 
 
199 aa  185  4e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.772676  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4947  nitroreductase  48.94 
 
 
203 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.907105  normal  0.53209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2245  nitroreductase  47.89 
 
 
197 aa  178  4.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0111  putative nitroreductase  47.94 
 
 
198 aa  177  7e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1571  nitroreductase  47.94 
 
 
199 aa  177  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.160224  normal  0.163104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0014  nitroreductase family protein  45.88 
 
 
198 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4639  nitroreductase  47.85 
 
 
189 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.564298  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3221  nitroreductase  49.21 
 
 
198 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4273  nitroreductase  44.56 
 
 
199 aa  174  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4899  nitroreductase  46.81 
 
 
203 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.913687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4435  nitroreductase  45.74 
 
 
203 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.676369  normal  0.38334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3146  nitroreductase  45.03 
 
 
200 aa  169  4e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3947  nitroreductase  43.68 
 
 
199 aa  168  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2772  nitroreductase  44.21 
 
 
200 aa  168  6e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3177  putative NADH dehydrogenase/NAD(P)H nitroreductase  46.32 
 
 
204 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.999951  normal  0.135022 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1159  nitroreductase  43.98 
 
 
199 aa  160  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.250977  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3370  NAD(P)H-flavin oxidoreductase  42.11 
 
 
199 aa  157  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0510232  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2200  nitroreductase  42.93 
 
 
199 aa  156  2e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0875675  normal  0.438667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4328  nitroreductase  42.55 
 
 
199 aa  155  6e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.59961  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1659  nitroreductase  46.6 
 
 
233 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00583847  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2215  nitroreductase  48.17 
 
 
209 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0324809  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0150  hypothetical protein  46.93 
 
 
214 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.197759  normal  0.577731 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1732  nitroreductase  47.12 
 
 
209 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.639581  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0289  nitroreductase  42.46 
 
 
190 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1636  nitroreductase  48.62 
 
 
192 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0000151333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2000  nitroreductase  43.72 
 
 
213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.578725  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3075  nitroreductase  40.43 
 
 
198 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0345  nitroreductase  42.39 
 
 
212 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3562  nitroreductase  39.36 
 
 
200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2896  nitroreductase  38.92 
 
 
207 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.318005  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1829  nitroreductase  39.33 
 
 
200 aa  122  4e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00202262  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2102  nitroreductase  39.88 
 
 
200 aa  120  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3589  nitroreductase  37.63 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0432  nitroreductase  36.76 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181342  normal  0.330733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0406  nitroreductase  36.76 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.699033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2604  nitroreductase  37.1 
 
 
201 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.759207  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0501  nitroreductase  37.1 
 
 
201 aa  119  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2261  nitroreductase  38.81 
 
 
201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.746283  normal  0.134626 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0474  nitroreductase  37.1 
 
 
201 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.573695 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2805  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.360066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3612  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0028  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.901836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3601  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.735488  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3625  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.159047  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2267  nitroreductase family protein, putative  37.24 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2938  nitroreductase family protein  36.67 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1738  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3172  nitroreductase family protein  36.22 
 
 
201 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2730  nitroreductase  36.46 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.796867  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0427  oxidoreductase  37.3 
 
 
205 aa  111  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2838  nitroreductase  36.51 
 
 
223 aa  111  7.000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3531  nitroreductase  37.3 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.12812  normal  0.174487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4613  nitroreductase  40.53 
 
 
214 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.250865 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10883  Nitroreductase  36.17 
 
 
197 aa  107  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0215  nitroreductase  39.56 
 
 
210 aa  105  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2404  nitroreductase  40 
 
 
151 aa  99.8  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36390  nitroreductase  33.15 
 
 
199 aa  97.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0491  nitroreductase  34.57 
 
 
315 aa  96.3  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.807689 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2095  nitroreductase family protein  31.18 
 
 
189 aa  94.7  7e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5505  nitroreductase  34.07 
 
 
194 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0533827 
 
 
-
 
NC_002978  WD1207  nitroreductase family protein  31.25 
 
 
195 aa  90.5  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5012  nitroreductase  30.56 
 
 
191 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0181044  hitchhiker  0.00444875 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0551  nitroreductase  35.88 
 
 
321 aa  86.3  3e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1303  nitroreductase  34.64 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.805588 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0264  nitroreductase  34.94 
 
 
187 aa  85.9  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284109  hitchhiker  0.00114487 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4890  nitroreductase  34.05 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4979  nitroreductase  34.05 
 
 
199 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0537  nitroreductase  35.29 
 
 
321 aa  85.5  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5258  nitroreductase  33.51 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.656936 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0225  nitroreductase  33.71 
 
 
200 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.936652  normal  0.851937 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1639  nitroreductase  28.81 
 
 
184 aa  79  0.00000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15950  nitroreductase  28.49 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0057  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  32.35 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0458  nitroreductase  27.59 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.348313  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.4 
 
 
177 aa  65.5  0.0000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0212  nitroreductase  33.14 
 
 
184 aa  64.3  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.362808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  26.24 
 
 
168 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  30.29 
 
 
178 aa  63.5  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1513  nitroreductase  28.48 
 
 
180 aa  63.9  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000744029 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  29.19 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0589  nitroreductase  25.84 
 
 
192 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  24.29 
 
 
176 aa  61.6  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  28.3 
 
 
163 aa  60.1  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  28.19 
 
 
186 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  29.55 
 
 
173 aa  59.3  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  27.84 
 
 
170 aa  59.7  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  25.56 
 
 
180 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2684  nitroreductase  30.29 
 
 
178 aa  57.8  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.03 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.65 
 
 
176 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  27.12 
 
 
190 aa  55.5  0.0000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>