More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4809 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_4809  response regulator receiver protein  100 
 
 		 134 aa  273  5e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  48.74 
 
 		 847 aa  126  8.000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  47.2 
 
 		 1442 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 835 aa  118  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.6 
 
 		 631 aa  118  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  47.06 
 
 		 977 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0305  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.62 
 
 		 967 aa  117  3.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000133293 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1769  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.8 
 
 		 782 aa  117  4.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.497012  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  45.38 
 
 		 1499 aa  117  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.54 
 
 		 1313 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1639  histidine kinase  46.22 
 
 		 676 aa  115  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.576569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1723  response regulator receiver and Hpt phospho transfer protein  46.67 
 
 		 285 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.67 
 
 		 977 aa  114  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.85 
 
 		 1316 aa  115  3e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  42.42 
 
 		 1021 aa  115  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  50 
 
 		 763 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  40.15 
 
 		 1014 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1760  histidine kinase  42.62 
 
 		 671 aa  113  7.999999999999999e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  43.41 
 
 		 1346 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43670  putative sensor/response regulator hybrid  42.86 
 
 		 651 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  40 
 
 		 651 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3744  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.41 
 
 		 643 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.26 
 
 		 785 aa  111  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 		 758 aa  111  3e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.34 
 
 		 985 aa  111  4.0000000000000004e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0135  response regulator receiver domain-containing protein  47.22 
 
 		 132 aa  110  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.01 
 
 		 812 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.97 
 
 		 1042 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  45.24 
 
 		 850 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  43.18 
 
 		 925 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1546  histidine kinase  44.83 
 
 		 545 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 		 1090 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3203  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.54 
 
 		 765 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0763722 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  43.2 
 
 		 982 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4576  histidine kinase  43.7 
 
 		 678 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.354871 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3686  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  46.22 
 
 		 620 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.926172  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  46.22 
 
 		 727 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1062  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 		 695 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4211  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 633 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79688  normal  0.233659 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  43.44 
 
 		 1322 aa  107  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0057  histidine kinase  42.74 
 
 		 588 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000185994 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.36 
 
 		 1622 aa  107  5e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1670  ATPase domain-containing protein  42.31 
 
 		 750 aa  107  5e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.081803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  43.18 
 
 		 925 aa  107  5e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.97 
 
 		 948 aa  107  6e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 965 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.5 
 
 		 817 aa  107  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.83 
 
 		 1550 aa  107  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 818 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  42.74 
 
 		 578 aa  106  8.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 		 916 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0675189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 		 816 aa  105  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1875  histidine kinase  44.44 
 
 		 785 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0661847  normal  0.240097 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2212  sensor histidine kinase/response regulator  41.46 
 
 		 641 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3840  histidine kinase  44.44 
 
 		 785 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0989388  normal  0.369399 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 1040 aa  106  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4173  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 		 643 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  42.86 
 
 		 1177 aa  105  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2021  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  44.35 
 
 		 645 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.798842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 		 1124 aa  105  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  42.19 
 
 		 905 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3979  histidine kinase  41.27 
 
 		 778 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.405731  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 		 899 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.618287  normal  0.57938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1695  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 643 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 		 643 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 		 818 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0066  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 721 aa  105  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2168  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.38 
 
 		 1204 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.172741 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1069 aa  103  5e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1484  histidine kinase  42.74 
 
 		 785 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3839  histidine kinase  41.03 
 
 		 590 aa  103  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.21 
 
 		 1072 aa  103  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5275  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.9 
 
 		 830 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  41.94 
 
 		 968 aa  103  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003159  probable sensor/response regulator hybrid  43.22 
 
 		 566 aa  103  6e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0715  histidine kinase  41.53 
 
 		 553 aa  103  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.519915  normal  0.60104 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  44.07 
 
 		 827 aa  103  7e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.93 
 
 		 1369 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2331  sensor histidine kinase/response regulator  43.97 
 
 		 779 aa  103  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.02 
 
 		 990 aa  103  9e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0844  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  37.82 
 
 		 669 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.644717  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1187  two component system histidine kinase  37.82 
 
 		 683 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.572633  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.37 
 
 		 1305 aa  103  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1450  histidine kinase  42.74 
 
 		 785 aa  102  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106734  normal  0.251272 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.51 
 
 		 887 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  42.52 
 
 		 1468 aa  102  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1268  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 		 781 aa  103  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 737 aa  102  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02212  Signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 		 1054 aa  102  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1449  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 		 945 aa  102  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1134  two-component sensor  43.8 
 
 		 795 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0980947  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 1109 aa  102  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 631 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.15 
 
 		 1548 aa  102  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  43.55 
 
 		 786 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1650  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 		 917 aa  101  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.1856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0460  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  49.18 
 
 		 835 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.980587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.68 
 
 		 993 aa  102  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  45.76 
 
 		 923 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3174  GAF sensor hybrid histidine kinase  47.01 
 
 		 1087 aa  101  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134389 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>