172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2386 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2386  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 392 aa  760    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4671  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 398 aa  242  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0947  major facilitator transporter  40.1 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2706  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  27.12 
 
 		 404 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2970  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2191  major facilitator transporter  24.94 
 
 		 408 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1616  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 418 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0546554 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1813  major facilitator superfamiy transporter  25.21 
 
 		 429 aa  82  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.284415 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1849  major facilitator transporter  27.09 
 
 		 418 aa  77  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.513333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3143  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0613  major facilitator transporter  27.49 
 
 		 416 aa  73.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0957759  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3097  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 421 aa  69.7  0.00000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0288565 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1776  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.19 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3528  major facilitator transporter  23.68 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000328166  normal  0.125095 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0689  transport protein of the major facilitator  24.59 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1081  putative MFS family transporter protein  24.2 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1066  putative MFS family transporter protein  24.2 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0109071  normal  0.857423 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1001  putative MFS family transporter protein  24.2 
 
 		 382 aa  68.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0972  putative MFS family transporter protein  24.2 
 
 		 382 aa  68.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1598  twin-arginine translocation pathway signal  25.47 
 
 		 426 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.121654  normal  0.207213 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4270  major facilitator transporter  23.5 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0228  hypothetical protein  27.57 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.624133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1032  putative MFS family transporter protein  23.82 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3675  major facilitator transporter  25.42 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.491115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00902  putative MFS family transporter protein  23.41 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2745  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00909  hypothetical protein  23.41 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.80551  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2221  putative MFS family transporter protein  23.41 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707303 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1061  putative MFS family transporter protein  23.41 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2698  putative MFS family transporter protein  23.41 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1004  putative MFS family transporter protein  23.41 
 
 		 382 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0975  putative MFS family transporter protein  23.41 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0419  major facilitator superfamily MFS_1  23.22 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4258  major facilitator transporter  26.17 
 
 		 452 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.894959 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1953  major facilitator superfamily MFS_1  25.99 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.366446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3491  major facilitator transporter  26.2 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1700  putative MFS family transporter protein  22.06 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.289125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0839  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 464 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.673129  hitchhiker  0.000450742 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2680  putative MFS family transporter protein  22.55 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2592  putative MFS family transporter protein  22.55 
 
 		 382 aa  63.2  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1922  major facilitator family transporter  26.2 
 
 		 465 aa  62.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.628163  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1753  MFS permease  22.67 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.221329  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1547  major facilitator transporter  25.6 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1591  MFS permease  22.95 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.37561  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1918  MFS transporter  24.66 
 
 		 386 aa  62.4  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000771845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1301  major facilitator superfamily MFS_1  25.27 
 
 		 377 aa  61.2  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0203  major facilitator transporter  24.69 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.371325  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3470  major facilitator transporter  22.66 
 
 		 421 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2825  major facilitator transporter  27.42 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.122972  normal  0.402197 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3843  major facilitator superfamily MFS_1  24.92 
 
 		 397 aa  60.8  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0201188 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6086  MFS family transporter  26.76 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2660  major facilitator transporter  25.35 
 
 		 417 aa  60.5  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0691  hypothetical protein  23.69 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.256683  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2704  major facilitator superfamily MFS_1  24.09 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0156259  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0238  major facilitator transporter  25.76 
 
 		 382 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0608  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70120  putative MFS transporter  26.03 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0573  major facilitator family transporter  25.7 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1456  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.357176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4398  major facilitator family transporter  24.71 
 
 		 444 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.170292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3739  major facilitator transporter  25 
 
 		 443 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.272825  normal  0.734833 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1094  major facilitator transporter  24.83 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1275  major facilitator transporter  26.77 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0932939  normal  0.823078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1775  hypothetical protein  23.29 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.359075  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20680  putative MFS transporter  23.29 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1421  putative MFS family transporter protein  22.63 
 
 		 382 aa  57  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0986  major facilitator family transporter  21.53 
 
 		 726 aa  56.6  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3119  major facilitator transporter  25.63 
 
 		 420 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485846  normal  0.0384388 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0928  major facilitator transporter  24.67 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.569755 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1091  major facilitator transporter  23.35 
 
 		 376 aa  56.6  0.0000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.776047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3542  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 432 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0937  major facilitator family protein  26.05 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3959  major facilitator transporter  24.41 
 
 		 447 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.913585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3025  major facilitator transporter  25.43 
 
 		 375 aa  55.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1399  transporter, putative  26.67 
 
 		 404 aa  55.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.169631  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3112  hypothetical protein  25.88 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0751652 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0866  major facilitator family protein  25.14 
 
 		 395 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00300213  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0155  major facilitator superfamily MFS_1  23.63 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0903  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3377  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3242  major facilitator transporter  23.91 
 
 		 446 aa  54.7  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4144  major facilitator transporter  22.77 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.30134 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0414  transporter, MFS superfamily  23.36 
 
 		 411 aa  54.7  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.50103  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1292  major facilitator superfamily MFS_1  23.47 
 
 		 394 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0691449  hitchhiker  0.0026922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3245  major facilitator superfamily MFS_1  24.69 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.70819  normal  0.24214 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1802  major facilitator transporter  20.64 
 
 		 713 aa  54.3  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.792644  normal  0.0946092 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3325  major facilitator transporter  22.95 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3745  major facilitator superfamily MFS_1  23.38 
 
 		 388 aa  53.5  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4927  major facilitator superfamily MFS_1  24.12 
 
 		 389 aa  53.5  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.185526 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3083  multidrug-efflux protein  22.34 
 
 		 398 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0261519  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5533  major facilitator transporter  23.43 
 
 		 381 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.316632  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1710  major facilitator transporter  26.47 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.69138  normal  0.65846 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0837  hypothetical protein  23.32 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2433  major facilitator transporter  24.85 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0171851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7414  major facilitator superfamily MFS_1  24.68 
 
 		 388 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.085887  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1718  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 429 aa  52.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.150429 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3941  major facilitator superfamily MFS_1  25.71 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1427  major facilitator superfamily MFS_1  24.58 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1179  transmembrane transport protein  21.84 
 
 		 407 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>