176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0872 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  100 
 
 
345 aa  715    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  75.52 
 
 
343 aa  525  1e-148  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  73.45 
 
 
343 aa  525  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  74.18 
 
 
359 aa  525  1e-148  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  72.02 
 
 
358 aa  512  1e-144  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  41.18 
 
 
483 aa  281  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  40.78 
 
 
491 aa  277  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  40.64 
 
 
481 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  40.25 
 
 
479 aa  276  4e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  39.51 
 
 
479 aa  275  6e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  40.25 
 
 
479 aa  275  9e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  38.59 
 
 
485 aa  266  5e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 
777 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
810 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
844 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  38.83 
 
 
413 aa  251  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 
791 aa  246  4e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  37.44 
 
 
791 aa  245  9e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  36.52 
 
 
791 aa  238  9e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  38.64 
 
 
324 aa  215  7e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  37.01 
 
 
313 aa  199  6e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  31.4 
 
 
775 aa  194  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  36.71 
 
 
318 aa  185  8e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  35.06 
 
 
315 aa  183  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  32.49 
 
 
347 aa  182  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  33.24 
 
 
373 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  32.54 
 
 
484 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  34.91 
 
 
315 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  33.63 
 
 
316 aa  163  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  32.61 
 
 
381 aa  163  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  31.85 
 
 
456 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  31.35 
 
 
454 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  32.01 
 
 
379 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  32.29 
 
 
438 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  32.29 
 
 
438 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  33.43 
 
 
389 aa  161  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  34.51 
 
 
320 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  33.33 
 
 
439 aa  160  4e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  30.85 
 
 
443 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.07 
 
 
416 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.07 
 
 
416 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  31.07 
 
 
416 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  33.63 
 
 
316 aa  157  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  33.43 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  33.33 
 
 
321 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  33.82 
 
 
315 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  36.71 
 
 
418 aa  152  8.999999999999999e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  31.04 
 
 
312 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  32.13 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  31.22 
 
 
479 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  30.7 
 
 
498 aa  144  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  33.24 
 
 
412 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  31.29 
 
 
313 aa  140  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.54 
 
 
322 aa  139  8.999999999999999e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.4 
 
 
319 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.4 
 
 
319 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  32.19 
 
 
328 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.09 
 
 
319 aa  135  8e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  32.58 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.47216 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  32.2 
 
 
318 aa  130  3e-29  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  31.25 
 
 
314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  30.58 
 
 
312 aa  128  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  31.58 
 
 
314 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  34.3 
 
 
315 aa  126  6e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  30.18 
 
 
312 aa  126  6e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  31.82 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  31.41 
 
 
291 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  27.35 
 
 
360 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  29.39 
 
 
339 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  30.96 
 
 
310 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  31.09 
 
 
300 aa  119  6e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  28.84 
 
 
303 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  28.53 
 
 
303 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  29.67 
 
 
337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  28.3 
 
 
299 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  29.08 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  28.4 
 
 
342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  29.24 
 
 
337 aa  114  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  38.99 
 
 
303 aa  112  7.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  32.45 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  32.32 
 
 
336 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  30.06 
 
 
298 aa  108  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.88 
 
 
329 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  30.43 
 
 
303 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  30.43 
 
 
303 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  28.78 
 
 
366 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  28.78 
 
 
337 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  28.78 
 
 
337 aa  105  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2418  acetamidase/formamidase family protein  28.92 
 
 
304 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.397586  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2342  acetamidase  28.92 
 
 
304 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.640951  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2596  acetamidase/formamidase family protein  28.92 
 
 
304 aa  104  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.669172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.37 
 
 
305 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  29.84 
 
 
340 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  32.21 
 
 
339 aa  102  8e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  35.9 
 
 
332 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  29.66 
 
 
304 aa  101  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1205  Acetamidase/Formamidase  35.9 
 
 
303 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.931708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0828  acetamidase/formamidase  26.48 
 
 
285 aa  101  2e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2616  acetamidase/formamidase family protein  27.31 
 
 
304 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00237605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3207  putative acetamidase/formamidase family protein  26.05 
 
 
329 aa  100  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>