283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0866 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0866  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  100 
 
 
424 aa  865    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0759953  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0455  allantoate amidohydrolase  47.74 
 
 
408 aa  371  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1161  amidase  49.12 
 
 
431 aa  362  1e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441766  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02498  allantoate amidohydrolase  45.75 
 
 
411 aa  360  4e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2051  allantoate amidohydrolase  44.63 
 
 
408 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3185  allantoate amidohydrolase  44.89 
 
 
427 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3324  allantoate amidohydrolase  44.89 
 
 
427 aa  348  8e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3334  allantoate amidohydrolase  44.89 
 
 
427 aa  348  1e-94  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.976999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0937  allantoate amidohydrolase  45.9 
 
 
418 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.275472  normal  0.990887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2423  amidase, hydantoinase/carbamoylase family protein  43.07 
 
 
411 aa  333  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000367086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3464  allantoate amidohydrolase  43.03 
 
 
429 aa  332  6e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.962602  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3308  allantoate amidohydrolase  44.5 
 
 
417 aa  330  3e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3705  allantoate amidohydrolase  44.79 
 
 
433 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2079  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.62 
 
 
420 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6770  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.08 
 
 
416 aa  324  1e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1389  amidase hydantoinase/carbamoylase family  43.22 
 
 
415 aa  323  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0995046  normal  0.188335 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0882  allantoate amidohydrolase  44.33 
 
 
416 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1838  amidase  43.35 
 
 
424 aa  317  3e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1784  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  45.75 
 
 
407 aa  316  4e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.210554 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3278  allantoate amidohydrolase  43.85 
 
 
417 aa  315  7e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0912  allantoate amidohydrolase  44.72 
 
 
416 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.435132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1370  allantoate amidohydrolase  42.5 
 
 
421 aa  306  3e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0218  allantoate amidohydrolase  43.65 
 
 
429 aa  296  6e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0387479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1945  allantoate amidohydrolase  42.11 
 
 
420 aa  295  9e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0435215  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3443  allantoate amidohydrolase  43.33 
 
 
418 aa  294  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2689  allantoate amidohydrolase  39.04 
 
 
406 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0667838  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3289  amidase  41.48 
 
 
426 aa  287  2.9999999999999996e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0766744  normal  0.806824 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2786  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  42.19 
 
 
424 aa  286  4e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000941896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1423  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.58 
 
 
591 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.202034 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01759  hypothetical protein  38.17 
 
 
415 aa  283  5.000000000000001e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1179  allantoate amidohydrolase  40.4 
 
 
409 aa  282  9e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2109  unknown domain/N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase fusion protein  40.9 
 
 
591 aa  278  1e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0454035 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2610  allantoate amidohydrolase  39.02 
 
 
419 aa  276  6e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3176  allantoate amidohydrolase  40.45 
 
 
409 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.183247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3341  allantoate amidohydrolase  37.97 
 
 
409 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1110  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.04 
 
 
593 aa  270  4e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.369908  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1854  allantoate amidohydrolase  40.05 
 
 
425 aa  269  8.999999999999999e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4389  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  44.16 
 
 
599 aa  268  1e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.707677  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1036  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40.1 
 
 
589 aa  267  2.9999999999999995e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2091  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  38 
 
 
415 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131869  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1115  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.36 
 
 
589 aa  264  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.845935  normal  0.677429 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0776  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.51 
 
 
599 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0165  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  37.91 
 
 
594 aa  247  3e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0354  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  41.21 
 
 
592 aa  241  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.584066  normal  0.0196277 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1099  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  39.47 
 
 
592 aa  241  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.581105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3928  putative bifunctional OHCU decarboxylase/allantoate amidohydrolase  40 
 
 
592 aa  240  2.9999999999999997e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.744958  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0781  allantoate amidohydrolase  34.4 
 
 
412 aa  237  3e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0746  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.9 
 
 
412 aa  232  9e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1787  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.92 
 
 
410 aa  231  2e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.105508  normal  0.371665 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3946  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.42 
 
 
421 aa  227  2e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2070  N-carbamoyl-L-amino acid hydrolase (L-carbamoylase)  33.33 
 
 
411 aa  226  5.0000000000000005e-58  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.251246  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7539  allantoate amidohydrolase  34.51 
 
 
419 aa  225  1e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2259  allantoate amidohydrolase  34.66 
 
 
428 aa  218  1e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2640  allantoate amidohydrolase  35.47 
 
 
422 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1386  amidase hydantoinase/carbamoylase family  33.65 
 
 
430 aa  216  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000270015  normal  0.126217 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2632  allantoate amidohydrolase  35.51 
 
 
429 aa  216  9e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.610948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3207  amidase  33.33 
 
 
423 aa  214  2.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0180  allantoate amidohydrolase  34 
 
 
429 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1163  allantoate amidohydrolase  35.31 
 
 
479 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146469  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4534  allantoate amidohydrolase  35.52 
 
 
415 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.289917  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2034  allantoate amidohydrolase  35.88 
 
 
413 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.388418  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0027  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.58 
 
 
413 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2745  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.22 
 
 
417 aa  209  7e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4780  allantoate amidohydrolase  34.93 
 
 
415 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3022  amidase  37.04 
 
 
442 aa  207  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.597256  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2546  allantoate amidohydrolase  35.21 
 
 
422 aa  208  2e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4634  allantoate amidohydrolase  33.82 
 
 
426 aa  206  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.60427  normal  0.118111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6028  amidase  38.22 
 
 
431 aa  206  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3012  allantoate amidohydrolase  34.07 
 
 
425 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.980217 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3535  allantoate amidohydrolase  34.68 
 
 
437 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1945  allantoate amidohydrolase  35.16 
 
 
416 aa  204  3e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1931  amidase, hydantoinase/carbamoylase  36.27 
 
 
415 aa  203  4e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.876695  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3376  allantoate amidohydrolase  36.6 
 
 
422 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0228  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.2 
 
 
422 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.185353  normal  0.235064 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3949  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  33.87 
 
 
407 aa  202  9e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193056  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4363  allantoate amidohydrolase  33.65 
 
 
426 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0103838 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0379  amidase, hydantoinase/carbamoylase  35.38 
 
 
415 aa  202  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.480246  normal  0.16493 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2881  allantoate amidohydrolase  35.57 
 
 
416 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.138552 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1680  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.363282  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0251  allantoate amidohydrolase  34.2 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3964  allantoate amidohydrolase  35.48 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.790477  normal  0.0143809 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1225  allantoate amidohydrolase  36.58 
 
 
423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.56571 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0772  allantoate amidohydrolase  35.86 
 
 
425 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177397  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1253  allantoate amidohydrolase  35.86 
 
 
425 aa  199  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.158158  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4258  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.49 
 
 
412 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6569  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.05 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.13575  normal  0.0102447 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_3979  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  35.32 
 
 
419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1769  allantoate amidohydrolase  34.32 
 
 
471 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.494309  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1132  allantoate amidohydrolase  36.55 
 
 
423 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4353  allantoate amidohydrolase  34.22 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243938  normal  0.131907 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1144  allantoate amidohydrolase  36.55 
 
 
423 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.942572  normal  0.284268 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4022  amidase  35.01 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0660  allantoate amidohydrolase  34.34 
 
 
425 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4042  allantoate amidohydrolase  32.99 
 
 
411 aa  196  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.00143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0419  allantoate amidohydrolase  37.56 
 
 
418 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0629  allantoate amidohydrolase  35.03 
 
 
414 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.223457 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3623  allantoate amidohydrolase  33.89 
 
 
415 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1099  allantoate amidohydrolase  33.26 
 
 
459 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3463  amidase, hydantoinase/carbamoylase family  36.39 
 
 
418 aa  196  1e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0097  allantoate amidohydrolase  33.26 
 
 
459 aa  195  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.201196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>