More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3161 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3161  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 442 aa  834    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.586334 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2754  major facilitator superfamily MFS_1  53.9 
 
 		 430 aa  405  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1385  major facilitator superfamily MFS_1  53.1 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  57.42 
 
 		 438 aa  377  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  25.21 
 
 		 395 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  25.06 
 
 		 410 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0805  major facilitator superfamily MFS_1  26.8 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.659867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  25.45 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 419 aa  67  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  27.13 
 
 		 406 aa  67  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.87 
 
 		 407 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1765  major facilitator transporter  24.44 
 
 		 376 aa  66.2  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3286  major facilitator superfamily MFS_1  25.76 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1056  major facilitator transporter  22.82 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0999083  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  29.25 
 
 		 401 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  26.72 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1767  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7849  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.42 
 
 		 485 aa  64.3  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.444789 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  23.31 
 
 		 388 aa  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1459  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.135074  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  27.92 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0291  major facilitator superfamily MFS_1  23.92 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  39.78 
 
 		 497 aa  63.2  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0410  multidrug-efflux transporter  29.94 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3078  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 457 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.493541  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  24.33 
 
 		 409 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3339  putative multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000037408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.26 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0381  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 414 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0535  major facilitator transporter  33.14 
 
 		 403 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0328031  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  36.36 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  36.73 
 
 		 504 aa  61.6  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  29.8 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  40 
 
 		 429 aa  61.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  36.56 
 
 		 516 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  34.29 
 
 		 480 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1990  putative multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 409 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.492861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2085  putative multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000147189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2023  putative multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.52874e-46 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1819  multidrug resistance protein  26.96 
 
 		 432 aa  60.8  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.310045  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1802  permease; multidrug resistance protein  27.09 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47900  putative MFS transporter  33.8 
 
 		 480 aa  60.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00274323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8987  EmrB/QacA family drug resistance transporter  37.23 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  23.18 
 
 		 387 aa  60.5  0.00000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  24.22 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3372  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.04 
 
 		 476 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000356155  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0873  major facilitator superfamily MFS_1  33.63 
 
 		 398 aa  59.7  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  35.42 
 
 		 503 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.3 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  0.0000683759 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1447  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  38.71 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.497094  normal  0.116148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  25.53 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08840  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.58 
 
 		 592 aa  59.3  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0084  major facilitator transporter  37.89 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4821  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.04 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4425  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.49 
 
 		 483 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.146647  normal  0.357206 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.13 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0415  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.04 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00273768  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4605  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.04 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000135395  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4459  multidrug resistance protein B  33.04 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0324211  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  31.85 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4961  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.04 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0262919  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0812  tetracycline resistance protein  37.21 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2891  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  39.56 
 
 		 539 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1778  major facilitator transporter  36.19 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000929318  normal  0.0431251 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04650  arabinose efflux permease family protein  34.78 
 
 		 405 aa  58.5  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  37.36 
 
 		 496 aa  58.9  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  23.96 
 
 		 400 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  39.56 
 
 		 594 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4827  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  33.04 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0487  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.79 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.130342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4851  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.16573  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4441  multidrug resistance protein B  32.17 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000526976  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2207  major facilitator superfamily MFS_1  22.95 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.78926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1124  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.84 
 
 		 489 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  38.54 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0977  major facilitator transporter  37.11 
 
 		 503 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00132044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.84 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2305  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  37.5 
 
 		 613 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4882  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 522 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4540  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09195  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0308711  normal  0.679663 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4807  major facilitator superfamily MFS_1  37.23 
 
 		 466 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000796608 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0224  major facilitator superfamily MFS_1  40.96 
 
 		 489 aa  57.8  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  37.11 
 
 		 510 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2168  major facilitator superfamily MFS_1  32.26 
 
 		 483 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.647242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1529  major facilitator transporter  38.14 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  36.46 
 
 		 397 aa  57.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.17 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0009  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.8 
 
 		 394 aa  57.8  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000450315 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0867  major facilitator transporter  29.93 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.551059  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 490 aa  57.8  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3936  putative drug resistance transporter  31.41 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  36.08 
 
 		 478 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  36.84 
 
 		 509 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2064  major facilitator transporter  27.17 
 
 		 403 aa  57  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 391 aa  56.6  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>