More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1602 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1602  TrkA-N domain protein  100 
 
 
228 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.316093  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1276  TrkA-N domain protein  67.11 
 
 
228 aa  313  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.283168  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2258  TrkA-N domain protein  66.97 
 
 
236 aa  297  7e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0633  TrkA-N domain protein  67.12 
 
 
248 aa  293  1e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1184  TrkA-N domain protein  53 
 
 
218 aa  227  1e-58  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1539  TrkA-N domain protein  51.83 
 
 
222 aa  216  2e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.465203  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1173  TrkA-N domain protein  52.58 
 
 
221 aa  207  1e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2420  TrkA-N domain protein  52.31 
 
 
220 aa  203  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  31.08 
 
 
222 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  33.17 
 
 
443 aa  89.4  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  30.67 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
229 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  33.18 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
229 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  30.84 
 
 
217 aa  86.3  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  27.15 
 
 
221 aa  85.9  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  30.17 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  29.55 
 
 
253 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  32.21 
 
 
220 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  26.94 
 
 
221 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 
299 aa  83.2  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  29.95 
 
 
219 aa  82.8  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  32.13 
 
 
231 aa  81.6  0.000000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  27.39 
 
 
249 aa  80.9  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  25.79 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  28.57 
 
 
223 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.84 
 
 
450 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  29.81 
 
 
219 aa  79.3  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  29.81 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  29.9 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3473  TrkA-N domain protein  31.13 
 
 
442 aa  78.2  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.249749  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1310  potassium transporter peripheral membrane component  30.96 
 
 
444 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  31.68 
 
 
231 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  34.25 
 
 
445 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  29.19 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  28.32 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 
241 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  27.7 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  27.8 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  28.7 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  29.21 
 
 
224 aa  72.8  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  29.02 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  28.85 
 
 
220 aa  72  0.000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  27.88 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  26.76 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  29.19 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1590  potassium transporter peripheral membrane component  28.5 
 
 
449 aa  70.5  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00906485  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  31.53 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  26.85 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0312  potassium transporter peripheral membrane component  28.02 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0720169  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.38 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3430  potassium transporter peripheral membrane component  29.68 
 
 
448 aa  69.7  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0375932  normal  0.146617 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  29.91 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  29.41 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  27.54 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.16 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  29.13 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  29.13 
 
 
222 aa  68.9  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  28.12 
 
 
221 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  27.93 
 
 
221 aa  68.2  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0038  potassium transporter peripheral membrane component  27.44 
 
 
458 aa  67.8  0.0000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  42.55 
 
 
617 aa  67.4  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  25.23 
 
 
221 aa  67.4  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0161  TrkA domain-containing protein  28.19 
 
 
231 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.825727 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.48 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_29  cation transport protein, Trk system  27.1 
 
 
454 aa  66.6  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  28.26 
 
 
226 aa  67  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  28.12 
 
 
457 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  27.05 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  28.29 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  28.23 
 
 
458 aa  65.9  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0029  potassium transporter peripheral membrane component  28.7 
 
 
454 aa  65.9  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  29.44 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  27.52 
 
 
458 aa  65.5  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  27.78 
 
 
465 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3063  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
214 aa  65.1  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  26.94 
 
 
458 aa  64.3  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3437  potassium transporter peripheral membrane component  31.28 
 
 
452 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0030  potassium transporter peripheral membrane component  29.44 
 
 
454 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3218  potassium transporter peripheral membrane component  26.82 
 
 
454 aa  63.5  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.715113  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0243  TrkA-N domain protein  28.43 
 
 
206 aa  63.2  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  29.78 
 
 
449 aa  63.2  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  26.73 
 
 
449 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  25.35 
 
 
220 aa  62.8  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  31.84 
 
 
450 aa  62.8  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  24.52 
 
 
221 aa  62.4  0.000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  25.69 
 
 
215 aa  62  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0890  TrkA-C domain protein  25.41 
 
 
446 aa  61.6  0.000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000220881  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  28.04 
 
 
214 aa  61.6  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  28.1 
 
 
227 aa  61.6  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  30.37 
 
 
445 aa  61.2  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13070  K+ transport system, NAD-binding component  29.68 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00265603  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1929  putative potassium uptake protein  31.34 
 
 
229 aa  61.2  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.123463  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2257  TrkA-N domain protein  35.45 
 
 
220 aa  61.6  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.222998  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  26.85 
 
 
332 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  32.59 
 
 
617 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  32.52 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2209  potassium transporter peripheral membrane component  25.23 
 
 
458 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2841  potassium transporter peripheral membrane component  29.22 
 
 
458 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.340173  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>