210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2260 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2260  KaiA binding  100 
 
 		 231 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00780772 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1062  KaiA binding  59.83 
 
 		 228 aa  280  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38736  normal  0.180687 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2890  KaiA binding protein  53.42 
 
 		 236 aa  269  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1860  KaiA binding  57.85 
 
 		 228 aa  267  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0048  putative circadian clock protein, KaiC  39.66 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1755  ATPase  35.92 
 
 		 247 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0444  KaiA binding protein  31.28 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3006  circadian clock protein KaiC  30.19 
 
 		 506 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1030  Non-specific serine/threonine protein kinase  32.61 
 
 		 498 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0618  circadian clock protein KaiC  30.33 
 
 		 514 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0716  putative circadian clock protein, KaiC  31.48 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0711817  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3934  circadian clock protein KaiC  30.19 
 
 		 507 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3983  circadian clock protein KaiC  30.19 
 
 		 507 aa  99.8  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0301115  normal  0.0187293 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3136  putative circadian clock protein, KaiC  32.07 
 
 		 498 aa  98.6  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00540403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1691  KaiC  25.85 
 
 		 259 aa  96.7  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.601669  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0135  putative circadian clock protein, KaiC  30.84 
 
 		 506 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.034427 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5760  putative circadian clock protein, KaiC  31.72 
 
 		 496 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2779  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.57 
 
 		 504 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2944  putative circadian clock protein, KaiC  32.47 
 
 		 496 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00911179  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4148  circadian clock protein KaiC  29.72 
 
 		 510 aa  91.3  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0860299 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5757  putative circadian clock protein, KaiC  32.09 
 
 		 481 aa  90.9  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.36007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3359  circadian clock protein KaiC  29.25 
 
 		 510 aa  89  6e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3030  Non-specific serine/threonine protein kinase  31.65 
 
 		 497 aa  88.6  8e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2554  putative circadian clock protein, KaiC  31.33 
 
 		 242 aa  87  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.445302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1657  putative circadian clock protein, KaiC  32.89 
 
 		 501 aa  86.3  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0483  putative circadian clock protein, KaiC  27.62 
 
 		 362 aa  85.9  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1702  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 		 499 aa  85.9  5e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.197448  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4712  non-specific serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 		 507 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0039  putative circadian clock protein, KaiC  31.25 
 
 		 505 aa  85.5  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0424208 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2609  hypothetical protein  29.74 
 
 		 505 aa  85.1  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0255  putative circadian clock protein, KaiC  27.71 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0555  putative circadian clock protein, KaiC  25.42 
 
 		 229 aa  84.7  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2398  hypothetical protein  27.88 
 
 		 508 aa  84.3  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.381909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2653  circadian clock protein KaiC  27.05 
 
 		 505 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.829711 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0758  KaiC  31.62 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.28576  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1102  non-specific serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 		 489 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15031  circadian clock protein KaiC  29.58 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.202998  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15431  circadian clock protein KaiC  30.05 
 
 		 509 aa  82.8  0.000000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15281  circadian clock protein KaiC  30.05 
 
 		 509 aa  82.4  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.788871  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1440  circadian clock protein KaiC  29.58 
 
 		 498 aa  82.4  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5730  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 		 480 aa  82  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0549  circadian clock protein KaiC  29.11 
 
 		 512 aa  81.6  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.131026  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0020  putative circadian clock protein, KaiC  28.63 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0019  non-specific serine/threonine protein kinase  28.63 
 
 		 520 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0794  hypothetical protein  28.99 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0913  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 		 500 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17691  circadian clock protein KaiC  30.37 
 
 		 500 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.157021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5592  hypothetical protein  29.25 
 
 		 480 aa  80.9  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13961  circadian clock protein KaiC  29.91 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.360169  normal  0.613548 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5974  non-specific serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 		 504 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.270987  normal  0.51709 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1661  putative circadian clock protein, KaiC  25.74 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.321518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5921  putative circadian clock protein, KaiC  32.23 
 
 		 502 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.3624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4356  circadian clock protein KaiC  27.88 
 
 		 509 aa  79  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.118548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0466  Non-specific serine/threonine protein kinase  29.52 
 
 		 463 aa  79  0.00000000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6620  putative circadian clock protein, KaiC  29.36 
 
 		 497 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2124  circadian clock protein KaiC  28.64 
 
 		 512 aa  79  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0996897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0547  hypothetical protein  26.5 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000268994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0561  hypothetical protein  26.5 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00523047  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05441  circadian clock protein KaiC  29.44 
 
 		 488 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1389  putative circadian clock protein, KaiC  26.16 
 
 		 402 aa  78.2  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.201888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2451  KaiC  24.78 
 
 		 494 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.970563  hitchhiker  0.00417767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0067  putative circadian clock protein, KaiC  28 
 
 		 532 aa  78.2  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.643949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1144  putative circadian clock protein, KaiC  29.82 
 
 		 265 aa  78.2  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.210299  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2689  putative circadian clock protein, KaiC  26.45 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2718  hypothetical protein  26.09 
 
 		 494 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150479  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0799  Sigma 54 interacting domain protein  24.79 
 
 		 242 aa  76.6  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0945  putative circadian clock protein, KaiC  26.61 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.553729  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1513  KaiC  25.33 
 
 		 459 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1332  non-specific serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723068 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6530  putative circadian clock protein, KaiC  30.74 
 
 		 501 aa  76.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1138  putative circadian clock protein, KaiC  29.06 
 
 		 482 aa  75.9  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  0.0108343 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1553  putative circadian clock protein, KaiC  26.8 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0908747  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3295  circadian clock protein KaiC  25.7 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.67536  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2268  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 503 aa  74.7  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00960812  normal  0.0645307 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1662  putative circadian clock protein, KaiC  27.62 
 
 		 472 aa  73.6  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.628139 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2453  putative circadian clock protein, KaiC  27.59 
 
 		 478 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1170  putative circadian clock protein, KaiC  29.18 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0984322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2044  Non-specific serine/threonine protein kinase  26.57 
 
 		 503 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5577  non-specific serine/threonine protein kinase  25.99 
 
 		 500 aa  71.6  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15364  normal  0.116511 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0297  putative circadian clock protein, KaiC  29.96 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.0000433674  normal  0.105078 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0524  putative circadian clock protein, KaiC  23.74 
 
 		 364 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1216  circadian clock protein KaiC  28.85 
 
 		 519 aa  70.5  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0596  putative circadian clock protein, KaiC  29.22 
 
 		 281 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.00351856  hitchhiker  0.0000057975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2357  putative circadian clock protein, KaiC  25.52 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0504614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0246  putative circadian clock protein, KaiC  27.2 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.168634  normal  0.157479 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3181  putative circadian clock protein, KaiC  30.05 
 
 		 494 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2238  putative circadian clock protein, KaiC  24.68 
 
 		 497 aa  69.7  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3805  circadian clock protein KaiC  27.7 
 
 		 519 aa  69.3  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.953262  normal  0.0822222 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3435  putative circadian clock protein, KaiC  30.57 
 
 		 492 aa  68.9  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3203  putative circadian clock protein, KaiC  28.23 
 
 		 481 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3984  circadian clock protein KaiC  26.98 
 
 		 570 aa  68.6  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.612648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3229  non-specific serine/threonine protein kinase  27.32 
 
 		 494 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0550  putative circadian clock protein, KaiC  25.81 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2353  putative circadian clock protein, KaiC  28.17 
 
 		 489 aa  67.8  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0689  putative circadian clock protein, KaiC  25.99 
 
 		 467 aa  67.8  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.95223  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1727  putative circadian clock protein, KaiC  28.9 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.806508 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1768  putative circadian clock protein, KaiC  28.9 
 
 		 280 aa  67.8  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00173937 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1545  putative circadian clock protein, KaiC  25 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.056031  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1520  putative circadian clock protein, KaiC  29.36 
 
 		 281 aa  67.8  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.554824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6728  putative circadian clock protein, KaiC  24.78 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>