More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0095 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2652  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.76 
 
 
765 aa  750    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4416  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.73 
 
 
755 aa  646    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.383824  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2398  ABC transporter, inner membrane subunit  50.67 
 
 
761 aa  723    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.220176  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  59.76 
 
 
756 aa  896    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.137711  normal  0.159136 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0537  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.95 
 
 
755 aa  639    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1135  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  76.1 
 
 
771 aa  1172    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.975413 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0095  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
775 aa  1563    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6147  membrane protein component of ABC phosphate transporter  47.27 
 
 
761 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.297705  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5236  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.41 
 
 
762 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.644471  normal  0.245739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0146  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.79 
 
 
762 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.212947  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5614  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.59 
 
 
760 aa  625  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.536938  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5375  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.54 
 
 
762 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.690335 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5040  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  46.07 
 
 
753 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.921779 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0180  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.21 
 
 
761 aa  611  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70850  membrane protein component of ABC phosphate transporter  48.46 
 
 
677 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.721295 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5328  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.91 
 
 
669 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.662544  hitchhiker  0.00483454 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5486  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  47.82 
 
 
677 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48590  Phosphate ABC-transporter, permease protein PstC  46.93 
 
 
762 aa  588  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2745  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.09 
 
 
751 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1698  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.61 
 
 
752 aa  568  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.719566 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1357  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
751 aa  559  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1408  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  44.64 
 
 
751 aa  548  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0601702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.28 
 
 
751 aa  544  1e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2734  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.15 
 
 
752 aa  544  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1434  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.32 
 
 
752 aa  545  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1723  phosphate ABC transporter, permease protein, putative  44.01 
 
 
738 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3168  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.2 
 
 
752 aa  532  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.618473  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3642  phosphate ABC transporter, permease protein  39.95 
 
 
778 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2627  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.21 
 
 
752 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2560  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.29 
 
 
752 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
752 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0241057  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1538  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
752 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01031  hypothetical protein  42.71 
 
 
734 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1566  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.51 
 
 
752 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.637323  normal  0.18855 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1501  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.93 
 
 
752 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000210465  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2818  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.38 
 
 
752 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004380  phosphate transport system permease protein PstC  42.65 
 
 
734 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2454  phosphate import protein, transmembrane component PstC  40.67 
 
 
735 aa  511  1e-143  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.530002  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0258  phosphate ABC transporter, permease protein  43.36 
 
 
731 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0619  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.96 
 
 
641 aa  455  1.0000000000000001e-126  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3158  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.54 
 
 
742 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3540  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.97 
 
 
724 aa  435  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.875094  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0656  ABC-type phosphate transport system, permease component  37.45 
 
 
742 aa  428  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.770286  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1334  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.54 
 
 
722 aa  421  1e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1345  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
719 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1228  phosphate ABC transporter, permease protein PstC  37.11 
 
 
743 aa  421  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2944  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.61 
 
 
722 aa  418  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1305  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.03 
 
 
784 aa  369  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.462831 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.81 
 
 
718 aa  370  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3267  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.12 
 
 
706 aa  355  2.9999999999999997e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1237  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.97 
 
 
743 aa  342  1e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0916528  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03151  putative phosphate ABC transporter, permease protein  41.72 
 
 
727 aa  270  5.9999999999999995e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4121  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.07 
 
 
336 aa  147  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4147  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.07 
 
 
336 aa  147  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4005  phosphate ABC transporter inner membrane protein  32.07 
 
 
336 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.475796  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0419  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.05 
 
 
325 aa  145  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.730812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4079  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.94 
 
 
357 aa  143  9.999999999999999e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0751  phosphate ABC transporter inner membrane protein  47.65 
 
 
297 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0108561  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1681  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.49 
 
 
387 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.091837  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1619  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.44 
 
 
388 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1244  phosphate ABC transporter permease  34.48 
 
 
387 aa  132  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.81986  normal  0.80225 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.11 
 
 
291 aa  131  5.0000000000000004e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1039  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  31.82 
 
 
387 aa  131  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0327987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21615  phosphate ABC transporter, permease protein PstA  42.38 
 
 
318 aa  129  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1234  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.69 
 
 
387 aa  129  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.352319 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1779  phosphate ABC transporter, permease protein  41.71 
 
 
296 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0704  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.61 
 
 
303 aa  127  1e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0356  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  29.62 
 
 
350 aa  125  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0241985  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0944  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.23 
 
 
387 aa  125  4e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1489  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  28.44 
 
 
343 aa  124  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.111462  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0794  phosphate ABC transporter permease  30.48 
 
 
320 aa  124  9e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0421  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  42.96 
 
 
290 aa  124  9e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0481  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.44 
 
 
645 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2546  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  36.41 
 
 
535 aa  122  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1061  phosphate ABC transporter permease  34.8 
 
 
298 aa  122  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0565  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  35.5 
 
 
296 aa  121  6e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134721  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2277  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.57 
 
 
646 aa  120  9e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0980  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.1 
 
 
303 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1261  phosphate ABC transporter permease  28.84 
 
 
492 aa  119  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0348  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.77 
 
 
291 aa  118  5e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000428257 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1571  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
291 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0488  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  39.04 
 
 
291 aa  117  7.999999999999999e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.456942  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1828  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.88 
 
 
314 aa  117  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1162  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
284 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2982  phosphate ABC transporter permease  41.24 
 
 
649 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3120  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.47 
 
 
456 aa  114  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.43315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0764  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  34.36 
 
 
297 aa  114  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.316 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0570  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.36 
 
 
292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1086  phosphate ABC transporter permease  27.6 
 
 
310 aa  113  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2887  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.04 
 
 
297 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.110489 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1477  phosphate ABC transporter permease  35.04 
 
 
418 aa  112  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2105  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  33.33 
 
 
283 aa  110  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1918  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstA  33.82 
 
 
604 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.396887  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4409  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  41.61 
 
 
296 aa  108  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3819  phosphate ABC transporter, permease component  31.11 
 
 
295 aa  108  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.37684 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1926  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.14 
 
 
309 aa  107  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0478834  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4156  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  32.24 
 
 
319 aa  107  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.128753  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2359  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  27.99 
 
 
358 aa  107  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0705  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  38.16 
 
 
301 aa  105  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0779351  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0287  phosphate ABC transporter, inner membrane subunit PstC  40.22 
 
 
315 aa  105  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0473771  normal  0.154696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>