216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1565 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1565  integrase family protein  100 
 
 		 376 aa  773    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0206581  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5176  integrase family protein  56.36 
 
 		 237 aa  262  6.999999999999999e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.795183  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5174  hypothetical protein  49.35 
 
 		 177 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.760582  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.93 
 
 		 295 aa  62  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  24.01 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  22.29 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  29.53 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  22.26 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  23.68 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  27.98 
 
 		 302 aa  59.3  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  22.36 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0666  Phage integrase, N-terminal SAM- like  22.27 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.555034  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  21.68 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  23.95 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  22.08 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  26.62 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  28.08 
 
 		 341 aa  54.3  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.42 
 
 		 324 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 		 295 aa  52.8  0.000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  27.57 
 
 		 307 aa  52.8  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  26.8 
 
 		 343 aa  52.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0189  Phage integrase  26.8 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  24.68 
 
 		 387 aa  52.4  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 295 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  29.35 
 
 		 295 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  21.94 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  26.75 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  23.9 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  22.62 
 
 		 309 aa  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  30.2 
 
 		 276 aa  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.17 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  28.86 
 
 		 330 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  24.03 
 
 		 313 aa  51.2  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  26.13 
 
 		 308 aa  50.8  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  25.68 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  21.94 
 
 		 307 aa  50.8  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  23.37 
 
 		 309 aa  50.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  31.68 
 
 		 294 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0562  integrase/recombinase  24.86 
 
 		 308 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0843058  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0872  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 324 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  26.49 
 
 		 310 aa  50.1  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  27.09 
 
 		 283 aa  50.1  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  44.19 
 
 		 387 aa  50.1  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.33 
 
 		 308 aa  49.7  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  22.15 
 
 		 324 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  29.3 
 
 		 322 aa  49.7  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6953  integrase family protein  25.62 
 
 		 405 aa  49.7  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00295  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.49 
 
 		 297 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  21.36 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  23.87 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7460  integrase family protein  29.5 
 
 		 418 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.8 
 
 		 282 aa  48.9  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  43.48 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  26.56 
 
 		 204 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  22.83 
 
 		 380 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  20.38 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  23.13 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  23.13 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.24 
 
 		 450 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1299  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.9 
 
 		 291 aa  48.9  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  41.3 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  23.5 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  23.3 
 
 		 301 aa  48.9  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 294 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  29.2 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 286 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.75 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  22.33 
 
 		 314 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  33.82 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  25.74 
 
 		 387 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.18 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  23.38 
 
 		 302 aa  47.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  33.82 
 
 		 387 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  26.67 
 
 		 306 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 295 aa  47.4  0.0004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0497  tyrosine recombinase XerC  22.94 
 
 		 324 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.237269  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  27.56 
 
 		 308 aa  47.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  39.53 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  26.87 
 
 		 274 aa  47  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  24.55 
 
 		 298 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.44 
 
 		 351 aa  47.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3904  phage integrase family site specific recombinase  43.48 
 
 		 122 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.908319  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  39.53 
 
 		 387 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0018  phage integrase family protein  25.98 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2391  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.47 
 
 		 311 aa  47  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  39.53 
 
 		 387 aa  46.6  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  24.04 
 
 		 180 aa  46.2  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7622  integrase family protein  25.62 
 
 		 405 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.530017 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.76 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 296 aa  46.2  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2175  phage integrase family protein  32.47 
 
 		 440 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.77 
 
 		 324 aa  46.2  0.0009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4330  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.59 
 
 		 298 aa  46.2  0.0009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  43.48 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  43.48 
 
 		 369 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>