55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1088 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1088  peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 190 aa  365  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155027  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  40.78 
 
 		 203 aa  97.8  7e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  41.62 
 
 		 202 aa  90.9  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  60.42 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  48.48 
 
 		 514 aa  50.8  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  56.82 
 
 		 515 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  56.82 
 
 		 515 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  46.75 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 		 409 aa  49.3  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  52.94 
 
 		 515 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  52.94 
 
 		 515 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  52.94 
 
 		 515 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  52.94 
 
 		 519 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  54.55 
 
 		 515 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  54.55 
 
 		 515 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  40.28 
 
 		 414 aa  45.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0425  peptidoglycan-binding LysM  46.75 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00647142  normal  0.149845 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0337  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.78 
 
 		 472 aa  46.2  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.000000027639  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13740  soluble lytic murein transglycosylase-like protein  51.11 
 
 		 390 aa  45.1  0.0006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1701  cell wall hydrolase SleB  47.06 
 
 		 203 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  47.37 
 
 		 1281 aa  44.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  37.7 
 
 		 216 aa  44.7  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 446 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  39.62 
 
 		 419 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  41.07 
 
 		 518 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 		 173 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0549  lytic transglycosylase, catalytic  37.68 
 
 		 638 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357331  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  43.64 
 
 		 849 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  44.9 
 
 		 633 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  47.83 
 
 		 327 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4268  peptidoglycan-binding LysM  36.08 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000954581  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  37.84 
 
 		 438 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1191  regulatory protein dnir  36.84 
 
 		 404 aa  43.5  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  32.56 
 
 		 483 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0876  stage VI sporulation protein D  47.73 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  32.47 
 
 		 474 aa  43.1  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  58.46 
 
 		 456 aa  42.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1763  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  47.83 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  45.61 
 
 		 168 aa  43.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  35.48 
 
 		 474 aa  42.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0411  hypothetical protein  47.83 
 
 		 314 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  29.79 
 
 		 506 aa  42.4  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  44.68 
 
 		 423 aa  42.4  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  40.43 
 
 		 751 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  40.32 
 
 		 466 aa  42.7  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  38.81 
 
 		 499 aa  42  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  43.75 
 
 		 470 aa  42  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2920  lytic transglycosylase, catalytic  31.37 
 
 		 587 aa  42  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.654046 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1908  NLP/P60 protein  42.59 
 
 		 298 aa  42  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  45.45 
 
 		 517 aa  41.6  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  38.24 
 
 		 255 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0689  Peptidoglycan-binding LysM  36.67 
 
 		 186 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 164 aa  41.6  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  38.89 
 
 		 477 aa  41.2  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3707  transglutaminase domain-containing protein  40.38 
 
 		 876 aa  41.2  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>