184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1699 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1699  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 
183 aa  347  6e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.578392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  46.5 
 
 
203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0063  peptidoglycan-binding LysM  45.95 
 
 
202 aa  115  5e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0180593  normal  0.117773 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1088  peptidoglycan-binding LysM  37.97 
 
 
190 aa  79  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155027  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  53.06 
 
 
1281 aa  57  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  42.71 
 
 
128 aa  56.6  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1855  Peptidoglycan-binding LysM  41.03 
 
 
414 aa  56.2  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  31.43 
 
 
447 aa  53.9  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  38.83 
 
 
733 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3314  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.96 
 
 
447 aa  52.4  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000664916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  42.68 
 
 
560 aa  52.4  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  50 
 
 
301 aa  52  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  42.86 
 
 
542 aa  52  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21400  Peptidoglycan-binding LysM  56.52 
 
 
500 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0821  Peptidoglycan-binding LysM  30.23 
 
 
164 aa  50.1  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0727806 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0147  cell wall hydrolase  40 
 
 
265 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2034  rare lipoprotein A  51.11 
 
 
168 aa  49.7  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13997  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3974  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.86 
 
 
270 aa  49.3  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000260277  unclonable  0.000000000113169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  53.33 
 
 
483 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  53.33 
 
 
483 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  53.33 
 
 
483 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1069  peptidoglycan-binding LysM  45.65 
 
 
168 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1908  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  53.33 
 
 
483 aa  48.9  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1838  peptidoglycan-binding LysM  34.95 
 
 
443 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.858327  unclonable  0.000000000675364 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  40 
 
 
557 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  39.25 
 
 
590 aa  48.5  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3208  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.23 
 
 
455 aa  48.1  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058641  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  33.04 
 
 
438 aa  48.1  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3908  lytic transglycosylase catalytic  36.17 
 
 
544 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0496507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  33.82 
 
 
498 aa  47.8  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1716  peptidoglycan-binding LysM  52 
 
 
597 aa  47.8  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.925679  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0569  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.23 
 
 
471 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  45.1 
 
 
523 aa  47.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0480  NLP/P60 protein  52.17 
 
 
285 aa  47.4  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218691  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3005  peptidoglycan-binding LysM  47.83 
 
 
423 aa  47.4  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000564074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  41.54 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  41.1 
 
 
563 aa  47  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0794  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  39.62 
 
 
440 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345459 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  48.89 
 
 
477 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.84 
 
 
1001 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07930  cell wall hydrolase SleB  44.64 
 
 
310 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  34.21 
 
 
495 aa  46.2  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65370  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 
475 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0527105  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3028  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.68 
 
 
435 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0809739  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  36.61 
 
 
619 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2798  cell wall hydrolase, SleB  38.98 
 
 
277 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  48.89 
 
 
471 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0632  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.23 
 
 
471 aa  47  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.419176 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2755  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.83 
 
 
581 aa  46.6  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00949544  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0528  hypothetical protein  70 
 
 
431 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.617097  normal  0.16882 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.43 
 
 
527 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0560  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
507 aa  47  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0820449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  44.79 
 
 
250 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  42.55 
 
 
528 aa  46.6  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  43.48 
 
 
440 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3606  cell wall hydrolase  37.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000694282  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3503  cell wall hydrolase  37.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  9.350139999999999e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3515  cell wall hydrolase; spore-cortex lytic enzyme  37.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000982818  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3774  putative cell wall hydrolase  37.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000351199 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3893  cell wall hydrolase  37.14 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000146791  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  44.44 
 
 
474 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  54.35 
 
 
503 aa  45.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1239  Peptidoglycan-binding LysM  46.43 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00144568  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  49.06 
 
 
620 aa  46.2  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2810  serine/threonine kinase protein  66.67 
 
 
1034 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.855533  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3533  cell wall hydrolase SleB  35.71 
 
 
265 aa  46.2  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000255893  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4945  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  41.07 
 
 
471 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 
1021 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  44.44 
 
 
474 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  45.83 
 
 
571 aa  45.8  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0954  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.48 
 
 
422 aa  45.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1448  Peptidase M23  50 
 
 
509 aa  45.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000360423  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  36.84 
 
 
393 aa  45.1  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1274  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  41.18 
 
 
497 aa  45.1  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.730541  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  44.44 
 
 
474 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  47.92 
 
 
455 aa  45.1  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  40.82 
 
 
405 aa  45.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0570  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  48.15 
 
 
452 aa  45.1  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000754253 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0071  Mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosamidase  36.84 
 
 
303 aa  45.1  0.0006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.616993  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  45.83 
 
 
576 aa  45.1  0.0006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  46 
 
 
406 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.94 
 
 
406 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.94 
 
 
455 aa  45.1  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3522  SCP-like extracellular  43.75 
 
 
290 aa  44.7  0.0007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.490521  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.94 
 
 
406 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.94 
 
 
406 aa  44.7  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4173  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.59 
 
 
439 aa  44.7  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  46.81 
 
 
472 aa  44.7  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  41.67 
 
 
446 aa  44.7  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  51.06 
 
 
397 aa  44.7  0.0008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  44.44 
 
 
503 aa  44.3  0.0009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4688  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  44.23 
 
 
477 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.802168  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1436  putative cell wall hydrolase  42.11 
 
 
265 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000951619  hitchhiker  0.000921187 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  48.98 
 
 
327 aa  44.3  0.0009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  45.65 
 
 
788 aa  43.9  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0661  Lytic transglycosylase catalytic  33.87 
 
 
415 aa  44.3  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.398223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  51.43 
 
 
265 aa  44.3  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1840  cell wall hydrolase SleB  43.48 
 
 
264 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2106  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  47.92 
 
 
509 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0051  peptidoglycan-binding LysM  35.29 
 
 
436 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.492826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>