More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0444 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0444  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 		 848 aa  1743    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0671851  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0754  penicillin-binding protein, 1A family  40.56 
 
 		 796 aa  592  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  35.57 
 
 		 830 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0754  penicillin-binding protein, 1A family  35.63 
 
 		 818 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000281003  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0010  peptidoglycan synthetase; penicillin-binding protein 1A  36.99 
 
 		 797 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.00000000000000754529  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4406  1A family penicillin-binding protein  35.62 
 
 		 818 aa  434  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000928316  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  34.4 
 
 		 829 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  34.82 
 
 		 827 aa  426  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  35.17 
 
 		 841 aa  425  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2223  penicillin-binding protein 1A, putative  36.62 
 
 		 829 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1877  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.62 
 
 		 829 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2676  1A family penicillin-binding protein  34.56 
 
 		 795 aa  418  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.21019 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  34.41 
 
 		 804 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3195  1A family penicillin-binding protein  34.5 
 
 		 773 aa  413  1e-114  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  34.16 
 
 		 791 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0803  penicillin-binding protein, 1A  34.3 
 
 		 823 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  33.83 
 
 		 815 aa  408  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0934  1A family penicillin-binding protein  32.32 
 
 		 803 aa  409  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.305447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 814 aa  408  1.0000000000000001e-112  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  33.61 
 
 		 843 aa  409  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2534  1A family penicillin-binding protein  34.03 
 
 		 804 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.401637  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0324  penicillin-binding protein, 1A family  33.21 
 
 		 802 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  33.25 
 
 		 831 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  34 
 
 		 814 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  33.56 
 
 		 777 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  34.37 
 
 		 838 aa  396  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2147  penicillin-binding protein 1A  32.94 
 
 		 831 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.173589  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4669  1A family penicillin-binding protein  33.17 
 
 		 804 aa  392  1e-107  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  34.09 
 
 		 778 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4201  putative membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein  33.21 
 
 		 835 aa  387  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603081  normal  0.772793 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  31.59 
 
 		 805 aa  387  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.25 
 
 		 817 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  33.87 
 
 		 778 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  33.69 
 
 		 800 aa  389  1e-106  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  34.13 
 
 		 837 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  34.41 
 
 		 839 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  34.41 
 
 		 839 aa  387  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  33.85 
 
 		 794 aa  383  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  33.24 
 
 		 799 aa  383  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2852  penicillin-binding protein 1A  33.21 
 
 		 830 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.456684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  31.74 
 
 		 790 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  34.28 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1708  1A family penicillin-binding protein  32.96 
 
 		 818 aa  385  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  33.37 
 
 		 823 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  34.28 
 
 		 839 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  34.28 
 
 		 839 aa  386  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  32.37 
 
 		 814 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1395  penicillin-binding protein, 1A family  31.31 
 
 		 809 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47778  normal  0.639288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  32.62 
 
 		 794 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  33.98 
 
 		 794 aa  382  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  32.37 
 
 		 814 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4271  peptidoglycan glycosyltransferase  33.65 
 
 		 843 aa  380  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.600271 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  31.8 
 
 		 797 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  33.11 
 
 		 799 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2444  penicillin-binding protein 1A  32.82 
 
 		 830 aa  381  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.257563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  32.8 
 
 		 792 aa  381  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1298  1A family penicillin-binding protein  33.29 
 
 		 833 aa  382  1e-104  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.144183  normal  0.788784 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  33.05 
 
 		 797 aa  378  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1918  penicillin-binding protein, 1A family  33.02 
 
 		 812 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.176585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5843  1A family penicillin-binding protein  31.83 
 
 		 808 aa  377  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.36925  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  33.66 
 
 		 846 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3007  penicillin-binding protein 1A  33.04 
 
 		 830 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.160235 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  31.76 
 
 		 817 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  32.62 
 
 		 779 aa  379  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  33.47 
 
 		 791 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1304  penicillin-binding protein, 1A family  31.34 
 
 		 819 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0651627 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3124  penicillin-binding protein 1A  33.08 
 
 		 807 aa  374  1e-102  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.31223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 817 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0060  1A family penicillin-binding protein  31.78 
 
 		 852 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.133649 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3215  penicillin-binding protein, 1A family  33.85 
 
 		 778 aa  374  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3955  penicillin-binding protein, 1A family  32.21 
 
 		 805 aa  371  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.204833  normal  0.755336 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  30.93 
 
 		 771 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0960  1A family penicillin-binding protein  32.3 
 
 		 817 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0340726 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  31.09 
 
 		 819 aa  371  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2534  penicillin-binding protein 1A  31.09 
 
 		 854 aa  369  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.175244 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  29.29 
 
 		 804 aa  372  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  32.45 
 
 		 839 aa  372  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2574  1A family penicillin-binding protein  32.01 
 
 		 791 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.95541 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3949  penicillin-binding protein, 1A family  32.03 
 
 		 805 aa  369  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.665129 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  32.18 
 
 		 796 aa  369  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  32.69 
 
 		 802 aa  369  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  30.9 
 
 		 766 aa  369  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  31.33 
 
 		 824 aa  369  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  33.25 
 
 		 839 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  32.78 
 
 		 839 aa  366  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 		 797 aa  365  3e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3662  1A family penicillin-binding protein  32.09 
 
 		 833 aa  364  3e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  32.93 
 
 		 839 aa  364  3e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  33.02 
 
 		 801 aa  364  4e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  31.55 
 
 		 797 aa  364  4e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  32.96 
 
 		 777 aa  363  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  32.96 
 
 		 777 aa  363  8e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  32.34 
 
 		 839 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  31.69 
 
 		 797 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  32.14 
 
 		 844 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  32.14 
 
 		 844 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  32.68 
 
 		 822 aa  361  3e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  32.5 
 
 		 774 aa  360  5e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  32.43 
 
 		 844 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1687  1A family penicillin-binding protein  32.75 
 
 		 875 aa  360  6e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.983861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>