More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1877 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1877  Peptidoglycan glycosyltransferase  100 
 
 		 829 aa  1687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2223  penicillin-binding protein 1A, putative  100 
 
 		 829 aa  1687    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  39.25 
 
 		 830 aa  505  1e-141  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  37.06 
 
 		 814 aa  483  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  37.36 
 
 		 777 aa  480  1e-134  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  38.2 
 
 		 804 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3799  peptidoglycan synthetase  36.87 
 
 		 850 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3765  peptidoglycan synthetase  36.87 
 
 		 850 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  38.55 
 
 		 793 aa  469  9.999999999999999e-131  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  36.78 
 
 		 801 aa  462  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3862  peptidoglycan synthetase  36.76 
 
 		 850 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  38.04 
 
 		 838 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3692  peptidoglycan synthetase  36.87 
 
 		 850 aa  466  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3690  peptidoglycan synthetase  36.87 
 
 		 850 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  38.3 
 
 		 793 aa  461  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  36.77 
 
 		 793 aa  459  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  38.21 
 
 		 839 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  37.89 
 
 		 837 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  38.21 
 
 		 839 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  37.12 
 
 		 794 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  37.12 
 
 		 794 aa  459  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  36.5 
 
 		 796 aa  458  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  38.21 
 
 		 839 aa  459  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.39 
 
 		 817 aa  459  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  36.61 
 
 		 852 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  37.52 
 
 		 840 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  36.47 
 
 		 778 aa  456  1e-127  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  37.35 
 
 		 839 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 		 840 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 		 846 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 		 840 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  36.49 
 
 		 840 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  37.56 
 
 		 839 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  36.29 
 
 		 792 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  37.48 
 
 		 833 aa  452  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  37.93 
 
 		 777 aa  452  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 840 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  35.91 
 
 		 791 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  36.73 
 
 		 840 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  36.36 
 
 		 799 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  36.94 
 
 		 779 aa  450  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  37.93 
 
 		 777 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  36.82 
 
 		 794 aa  449  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  37.81 
 
 		 790 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  37.47 
 
 		 766 aa  449  1.0000000000000001e-124  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  36.96 
 
 		 814 aa  447  1.0000000000000001e-124  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3133  1A family penicillin-binding protein  35.78 
 
 		 796 aa  444  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  37.25 
 
 		 771 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  34.59 
 
 		 805 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 		 803 aa  444  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  36.46 
 
 		 778 aa  445  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  36.54 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  37.09 
 
 		 836 aa  444  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3889  peptidoglycan synthetase  35.64 
 
 		 851 aa  446  1e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4611  peptidoglycan synthetase  35.22 
 
 		 852 aa  443  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.241075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  35.01 
 
 		 797 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  36.12 
 
 		 839 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  37.69 
 
 		 786 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4067  peptidoglycan synthetase  35.88 
 
 		 851 aa  442  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  35.01 
 
 		 796 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  34.89 
 
 		 797 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 797 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  35.65 
 
 		 791 aa  442  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  34.77 
 
 		 797 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  35.16 
 
 		 797 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  34.79 
 
 		 851 aa  441  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  35.81 
 
 		 839 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  36.89 
 
 		 802 aa  439  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3733  peptidoglycan synthetase  35.11 
 
 		 851 aa  438  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0219  peptidoglycan synthetase  35.11 
 
 		 851 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  35.26 
 
 		 797 aa  437  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  35.3 
 
 		 804 aa  437  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  35.07 
 
 		 824 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3972  peptidoglycan synthetase  35.11 
 
 		 851 aa  438  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  36.21 
 
 		 795 aa  439  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  35.69 
 
 		 839 aa  438  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  37.55 
 
 		 800 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  34.93 
 
 		 823 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  36.31 
 
 		 819 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0189  penicillin-binding protein, 1A family  34.18 
 
 		 827 aa  434  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  36.82 
 
 		 797 aa  435  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  35.97 
 
 		 803 aa  434  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4090  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 		 844 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1824  penicillin-binding protein 1A  36 
 
 		 843 aa  434  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0792156  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  37.72 
 
 		 793 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4119  1A family penicillin-binding protein  35.83 
 
 		 844 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.922666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0253  peptidoglycan synthetase  35.54 
 
 		 852 aa  435  1e-120  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.570569  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  34.45 
 
 		 835 aa  436  1e-120  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  35.81 
 
 		 839 aa  436  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  34.81 
 
 		 823 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  35.1 
 
 		 807 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4009  penicillin-binding protein, 1A family  35.48 
 
 		 844 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0171  penicillin-binding protein, 1A family  33.53 
 
 		 829 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000166752 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  37.12 
 
 		 774 aa  427  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0354  penicillin-binding protein 1A  33.66 
 
 		 841 aa  427  1e-118  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.75585  normal  0.103015 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4208  1A family penicillin-binding protein  36.16 
 
 		 822 aa  427  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  35.33 
 
 		 817 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  35.03 
 
 		 846 aa  426  1e-118  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3712  1A family penicillin-binding protein  35.57 
 
 		 839 aa  426  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.637834  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1716  penicillin-binding protein 1A  34.9 
 
 		 831 aa  426  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0706575  normal  0.372111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>