More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_0419 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008309  HS_0419  biotin--protein ligase  100 
 
 		 310 aa  629  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4471  biotin--protein ligase  41.46 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000340796  hitchhiker  0.00000000000240151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4468  biotin--protein ligase  41.46 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0221784  hitchhiker  0.00169649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4381  biotin--protein ligase  41.46 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4349  biotin--protein ligase  41.46 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000983671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4546  biotin--protein ligase  41.46 
 
 		 320 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000449604  hitchhiker  0.00000000138084 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0268  biotin--protein ligase  40.32 
 
 		 320 aa  225  6e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0393829  hitchhiker  0.0050705 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3943  biotin--protein ligase  41.14 
 
 		 320 aa  224  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.596693  decreased coverage  0.000472258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3740  biotin--protein ligase  41.21 
 
 		 319 aa  224  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00032759  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3895  biotin--protein ligase  38.78 
 
 		 319 aa  222  6e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.282712  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4017  bifunctional BirA, biotin operon repressor/biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  40.19 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0118949  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03854  biotin-protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0188201  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4207  biotin--protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000658318  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4421  biotin--protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000434302  hitchhiker  0.00072275 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5438  biotin--protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  219  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000183056  hitchhiker  0.00134266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4461  biotin--protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000740491  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4047  biotin--protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0641292  hitchhiker  0.00297103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03807  hypothetical protein  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4512  biotin--protein ligase  40.19 
 
 		 321 aa  220  3e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000295045  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2717  biotin--protein ligase  40 
 
 		 320 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000120108  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0195  biotin--protein ligase  39.42 
 
 		 319 aa  217  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000104624  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0201  biotin--protein ligase  38.14 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.286867  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002163  biotin-protein ligase/biotin operon repressor  38.73 
 
 		 321 aa  209  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3871  biotin--protein ligase  37.5 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000364778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0327  biotin--protein ligase  37.5 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0364706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0142  biotin--protein ligase  37.22 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.330287  normal  0.0344662 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3396  biotin--protein ligase  37.5 
 
 		 319 aa  207  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00240  biotin--protein ligase  37.66 
 
 		 321 aa  205  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4334  biotin--protein ligase  38.41 
 
 		 320 aa  202  6e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.152634  hitchhiker  0.00000000217796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0132  biotin--protein ligase  38.39 
 
 		 320 aa  200  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000234608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0219  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  37.7 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.440436  normal  0.968546 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4072  biotin--protein ligase  35.26 
 
 		 319 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.228403 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4174  biotin--protein ligase  34.94 
 
 		 319 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000228488  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0197  biotin--protein ligase  36.89 
 
 		 317 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00143406  hitchhiker  0.000849017 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0180  biotin--protein ligase  34.62 
 
 		 319 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0210584  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4706  biotin--protein ligase  35.46 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.144079  hitchhiker  0.00201782 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0184  biotin--protein ligase  34.94 
 
 		 319 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.570128  hitchhiker  0.00065537 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3775  biotin--protein ligase  34.71 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00231404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0154  biotin--protein ligase  36.86 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00266236  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0168  biotin--protein ligase  36.74 
 
 		 320 aa  185  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00063361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0183  biotin--protein ligase  34.08 
 
 		 319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00618712  normal  0.258521 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0182  biotin--protein ligase  34.08 
 
 		 319 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000279859  normal  0.096767 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2876  biotin--protein ligase  33.55 
 
 		 319 aa  182  6e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0214  biotin--protein ligase  35.26 
 
 		 319 aa  181  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03573  putative BirA bifunctional protein  35.02 
 
 		 328 aa  178  9e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.184427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3998  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  34.13 
 
 		 328 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00153965  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0915  biotin--(acetyl-CoA-carboxylase) ligase  34.37 
 
 		 332 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.277179  decreased coverage  0.000000181101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0177  biotin--protein ligase  34.08 
 
 		 319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0131379  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0406  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.12 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.617579  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0505  biotin-[acetyl-CoA-carboxylase] ligase  37.55 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4745  biotin--protein ligase  37.86 
 
 		 333 aa  160  2e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.167382  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0847  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  33.86 
 
 		 331 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0822  biotin-[acetylCoA carboxylase] holoenzyme synthetase and biotin operon repressor  34.17 
 
 		 333 aa  159  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0937  bifunctional protein birA  33.33 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1044  biotin operon repressor  33.33 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2081  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  39.92 
 
 		 325 aa  152  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1136  biotin--protein ligase  35.16 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1781  birA bifunctional protein  31.13 
 
 		 331 aa  149  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4564  biotin--protein ligase  32.7 
 
 		 335 aa  149  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1229  biotin--protein ligase  34.84 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0467  biotin--protein ligase  31.58 
 
 		 319 aa  149  8e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.800228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4766  biotin--protein ligase  32.2 
 
 		 321 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0199355  normal  0.789599 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0610  birA bifunctional protein  32.39 
 
 		 319 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3926  biotin--protein ligase  31.25 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0470  biotin--protein ligase  32.09 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0969933  normal  0.0169671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08620  biotin--protein ligase  32.91 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664696 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0437  biotin--protein ligase  30.42 
 
 		 319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.193351  hitchhiker  0.00820304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0702  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.39 
 
 		 319 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0362526  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4292  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.29 
 
 		 317 aa  132  5e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.422429  hitchhiker  0.0000115964 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0188  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  36.4 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5096  biotin--protein ligase  32.92 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000301513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2403  bifunctional protein BirA  35.08 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06050  biotin--protein ligase  31.89 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0460  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.08 
 
 		 331 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2082  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.12 
 
 		 329 aa  121  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0816  biotin--protein ligase  36.14 
 
 		 293 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0453  birA bifunctional protein  28.53 
 
 		 301 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0614  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.82 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.695389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3757  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  33.08 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.450721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0102  biotin--protein ligase  34.02 
 
 		 305 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0233  biotin--protein ligase  31.03 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0440  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.16 
 
 		 336 aa  108  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.028543  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0073  biotin--protein ligase  33.06 
 
 		 285 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.702906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0159  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  30.52 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000241219  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3253  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.63 
 
 		 256 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4140  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.84 
 
 		 264 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1588  biotin--(acetyl-COA-carboxylase) synthetase  27.93 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.202289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1871  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  29.19 
 
 		 332 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000312804  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2427  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  27.42 
 
 		 321 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1058  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.34 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.101759  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0875  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.7 
 
 		 325 aa  103  3e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.107744  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0086  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  26.67 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal  0.688317 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1317  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.57 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.61009  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1653  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  28.39 
 
 		 333 aa  103  5e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3652  biotin/acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.47 
 
 		 277 aa  102  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0948912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3953  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.87 
 
 		 268 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0227  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  31.73 
 
 		 262 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00038256 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02842  biotin--protein ligase  32.43 
 
 		 338 aa  101  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4716  biotin--acetyl-CoA-carboxylase ligase  32.17 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.492677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00660  biotin (acetyl-CoA carboxylase) synthetase  26.95 
 
 		 326 aa  99.8  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>