76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4112 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  100 
 
 		 414 aa  839    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  68.84 
 
 		 414 aa  616  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  70 
 
 		 416 aa  607  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  65.09 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  61.46 
 
 		 430 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  28.97 
 
 		 444 aa  72  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  20.24 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  28.26 
 
 		 870 aa  63.9  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 553 aa  63.5  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  26.7 
 
 		 376 aa  62  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  23.83 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.69 
 
 		 888 aa  57.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  21.93 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  24.47 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  23.37 
 
 		 364 aa  53.9  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  23.12 
 
 		 374 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  20.9 
 
 		 359 aa  51.6  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  26.98 
 
 		 913 aa  51.2  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  26.01 
 
 		 1222 aa  50.4  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 1223 aa  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1224 aa  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  23.65 
 
 		 913 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  26.97 
 
 		 844 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0339  outer membrane protein  26.83 
 
 		 588 aa  49.3  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0408659  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.13 
 
 		 827 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.82 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  27.74 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.82 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.82 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  27.54 
 
 		 855 aa  47.8  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  23.24 
 
 		 383 aa  47.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3579  hypothetical protein  24.17 
 
 		 420 aa  47.4  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00756138  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  25.68 
 
 		 917 aa  47  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1796  surface antigen (D15)  25.86 
 
 		 818 aa  46.6  0.0009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00389709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 827 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  22.88 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  31.07 
 
 		 560 aa  46.2  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0764  hypothetical protein  24.4 
 
 		 450 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.798576  unclonable  0.000000000101633 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  27.63 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.34 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4861  outer membrane protein, OMP85 family  26.71 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4699  OMP85 family outer membrane protein  26.71 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3772  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04054  hypothetical protein  26.71 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.723359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5738  outer membrane protein, OMP85 family  26.71 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  25.13 
 
 		 827 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4790  OMP85 family outer membrane protein  26.71 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4474  OMP85 family outer membrane protein  26.71 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  23.43 
 
 		 804 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  25.26 
 
 		 827 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04091  predicted outer membrane protein and surface antigen  26.71 
 
 		 577 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.602065  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  24.52 
 
 		 386 aa  45.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1561  OMP85 family outer membrane protein  26.86 
 
 		 817 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347163  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  37.23 
 
 		 587 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0459  surface antigen (D15)  26.46 
 
 		 578 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.679233  normal  0.136878 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.59 
 
 		 806 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  23.39 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.36 
 
 		 425 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  36.59 
 
 		 925 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2012  surface antigen (D15)  31.25 
 
 		 582 aa  45.1  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.451429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.35 
 
 		 807 aa  44.3  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.92 
 
 		 780 aa  44.3  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  23.39 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  26.32 
 
 		 826 aa  44.3  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  25.93 
 
 		 382 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  26.32 
 
 		 826 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  26.32 
 
 		 826 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  24.88 
 
 		 913 aa  43.5  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  25.17 
 
 		 913 aa  43.5  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  28.12 
 
 		 792 aa  43.5  0.007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4205  hypothetical protein  24.3 
 
 		 440 aa  43.1  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000231794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  26.26 
 
 		 416 aa  43.1  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  26.14 
 
 		 780 aa  43.1  0.008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  27.67 
 
 		 781 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.67 
 
 		 781 aa  42.7  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.85 
 
 		 801 aa  43.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>