135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3835 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3835  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  676    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3517  hypothetical protein  60.44 
 
 		 337 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000347699 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3451  hypothetical protein  58.53 
 
 		 300 aa  347  1e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0621  hypothetical protein  54.37 
 
 		 321 aa  341  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0768751  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2894  hypothetical protein  52.49 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0314909 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2586  hypothetical protein  48.73 
 
 		 317 aa  280  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2755  hypothetical protein  51.52 
 
 		 313 aa  275  7e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00513543  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0697  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 331 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.561487  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.18 
 
 		 477 aa  94  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.32 
 
 		 337 aa  92.8  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  27.83 
 
 		 528 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  25.27 
 
 		 597 aa  86.7  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0508  glycosyl transferase family protein  28.02 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.239818  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  25.43 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3183  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000292304  decreased coverage  0.0000016442 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0657  glycosyl transferase family protein  27.8 
 
 		 331 aa  68.9  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  24.46 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7649  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 		 352 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5927  succinoglycan biosynthesis protein  26.64 
 
 		 341 aa  67.8  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1274  glycosyl transferase family 2  28.24 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.655162  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0718  family 2 glycosyl transferase  25.31 
 
 		 352 aa  66.6  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00805458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1349  glycosyltransferase  29.96 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.589568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0913  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.48 
 
 		 341 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000688111  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  24.22 
 
 		 322 aa  66.6  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4523  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 336 aa  65.9  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.131272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  27.11 
 
 		 924 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0211  glycosyl transferase family protein  30.43 
 
 		 623 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0722  succinoglycan biosynthesis protein ExoA  24.17 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4957  glycosyl transferase family protein  27.04 
 
 		 330 aa  64.7  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.083679 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  24.69 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  23.24 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2453  glycosyl transferase family 2  24.62 
 
 		 328 aa  61.2  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2541  putative glycosyl transferase  25.59 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0466  glycosyl transferase family protein  28.49 
 
 		 302 aa  59.7  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0600433  unclonable  0.0000113237 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  33.58 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3195  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 		 394 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1959  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 329 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.465626 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0043  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  23.47 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1661  glycosyl transferase family protein  25.64 
 
 		 316 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.120479  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05860  glycosyl transferase  22.83 
 
 		 351 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181902 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3875  glycosyl transferase family 2  22.09 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0228  glycosyl transferase family protein  21.66 
 
 		 333 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000082788  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08480  glycosyl transferase  24.79 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.525807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  32.84 
 
 		 300 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  24.91 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1427  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.91 
 
 		 338 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2111  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4113  glycosyl transferase family 2  23.75 
 
 		 343 aa  56.2  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.902695  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2675  family 2 glycosyl transferase  28.44 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.384822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4805  glycosyl transferase family protein  26.82 
 
 		 339 aa  55.8  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1029  glycosyl transferase family protein  27.68 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  22.86 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1794  glycosyl transferase family 2  23.11 
 
 		 315 aa  53.9  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1063  glycosyl transferase family 2  27.32 
 
 		 307 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.991977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0838  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 368 aa  53.1  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.341692  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0399  glycosyl transferase family 2  26.84 
 
 		 454 aa  53.1  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0540  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 		 310 aa  53.1  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0761  glycosyl transferase group 1  28.29 
 
 		 748 aa  52.8  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0518  family 2 glycosyl transferase  27.5 
 
 		 754 aa  52  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00714685  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1580  glycosyl transferase family protein  34.48 
 
 		 598 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.47169 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  30.56 
 
 		 703 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  22.88 
 
 		 461 aa  50.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  24.03 
 
 		 311 aa  50.8  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2462  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 		 421 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.278728  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1519  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 		 310 aa  50.8  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.98 
 
 		 336 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2467  glycosyl transferase family protein  22.86 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1222  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.966529  normal  0.285342 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0487  glycosyl transferase family protein  23.2 
 
 		 284 aa  49.3  0.00009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.843285 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  25.42 
 
 		 403 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0839  glycosyltransferase-like protein  22.26 
 
 		 822 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  23.04 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01307  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  24.64 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2650  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 1177 aa  48.1  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5057  glycosyl transferase family protein  25.49 
 
 		 470 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0167  glycosyl transferase family 2  23.31 
 
 		 450 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3998  glycosyl transferase family protein  31.88 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.756459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3773  glycosyl transferase family 2  28.33 
 
 		 484 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3588  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 337 aa  48.1  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.690536  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11260  histidinol-phosphate phosphatase family protein  24.28 
 
 		 499 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130521  normal  0.23358 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1366  glycosyl transferase family protein  27.97 
 
 		 331 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.959052  normal  0.0372616 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2856  family 2 glycosyl transferase  26.03 
 
 		 326 aa  47.8  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1447  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 233 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0726839  normal  0.0201369 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3347  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 308 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2643  family 2 glycosyl transferase  26.86 
 
 		 321 aa  47  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10710  membrane sugar transferase  24.28 
 
 		 470 aa  47  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.456153 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1038  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 355 aa  46.6  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.378242  normal  0.03094 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2563  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 329 aa  46.6  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1097  glycosyl transferase family protein  25 
 
 		 326 aa  46.6  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.000713189  normal  0.938252 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  22.33 
 
 		 335 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0137  glycosyl transferase family protein  25.41 
 
 		 296 aa  46.6  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.145337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  24.6 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2677  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 1267 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3149  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 753 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  24.8 
 
 		 314 aa  45.4  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1198  glycosyl transferase family protein  23.91 
 
 		 318 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4453  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 		 314 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3253  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.24393  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>