More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0229 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0229  NUDIX hydrolase  100 
 
 
153 aa  312  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  74.15 
 
 
147 aa  233  9e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0154  mutT/nudix family protein  74.15 
 
 
147 aa  230  4.0000000000000004e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3639  NUDIX hydrolase  71.94 
 
 
142 aa  207  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3746  NUDIX hydrolase  72.66 
 
 
142 aa  207  4e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3147  NUDIX hydrolase  65.28 
 
 
144 aa  200  7e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.232456  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3170  NUDIX hydrolase  64.79 
 
 
179 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8400  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  36.59 
 
 
139 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
153 aa  71.6  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0096  NUDIX hydrolase  40.7 
 
 
141 aa  70.5  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0757202  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2700  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0600757  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  36.97 
 
 
146 aa  70.5  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1291  NUDIX hydrolase  36.57 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.327149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2360  putative mutator MutT protein  37.93 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2116  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3458  NUDIX hydrolase  35.94 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000764325 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2065  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4015  NUDIX hydrolase  36.89 
 
 
143 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.71 
 
 
146 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2157  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1775  NUDIX hydrolase  36.72 
 
 
129 aa  65.5  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.296323  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0299  mutator MutT protein  36.09 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1181  ADP-ribose pyrophosphatase  32.5 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.152697  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5292  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
163 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4327  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 
145 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.356422 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1128  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
141 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0349929  normal  0.45534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4056  mutator MutT protein  35.48 
 
 
131 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.640988  normal  0.0322443 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13970  NUDIX hydrolase  34.68 
 
 
146 aa  62.8  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0294014  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  41.89 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2004  NUDIX hydrolase  36.79 
 
 
162 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3001  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
134 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.759496  normal  0.595772 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  32.59 
 
 
141 aa  62  0.000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1065  NUDIX hydrolase  35.48 
 
 
151 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.595183  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0598  NUDIX hydrolase  32.26 
 
 
162 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1657  NUDIX hydrolase  33.6 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.809555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4181  A/G-specific adenine glycosylase  33.33 
 
 
386 aa  60.8  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1768  NUDIX hydrolase  33.08 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
147 aa  60.8  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  40.54 
 
 
156 aa  60.8  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0673  A/G-specific DNA-adenine glycosylase  31.97 
 
 
360 aa  60.5  0.000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.21066  normal  0.501858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2447  NUDIX hydrolase  31.62 
 
 
129 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000652481  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0157  hydrolase, NUDIX family  36.7 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1890  Mutator MutT  33.59 
 
 
142 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.620209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2595  NUDIX hydrolase  36.61 
 
 
148 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2640  mutt/nudix family protein  29.52 
 
 
156 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000776833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
155 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2042  NUDIX hydrolase  35.16 
 
 
129 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000547499 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2091  NUDIX hydrolase  36.47 
 
 
181 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2636  mutator MutT protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)  31.85 
 
 
133 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  34.94 
 
 
139 aa  58.9  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1303  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0131  NUDIX hydrolase  29.29 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  28.26 
 
 
158 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6097  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.347749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1522  NUDIX hydrolase  31.43 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.241436  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1980  NUDIX hydrolase  32.5 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5931  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  27.94 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0727  NUDIX/MutT family protein  33.33 
 
 
150 aa  58.2  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.371838  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2117  NUDIX hydrolase  36.27 
 
 
196 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.018357 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5566  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
153 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.600891  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  37.78 
 
 
155 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  28.33 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  30.37 
 
 
159 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1243  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1476  NUDIX hydrolase  38.16 
 
 
155 aa  57.8  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2201  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2289  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.648467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1203  NUDIX hydrolase  36.78 
 
 
149 aa  57.4  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  44.12 
 
 
155 aa  57  0.00000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0574  mutator MutT protein  32.79 
 
 
139 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.37378  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2817  NUDIX hydrolase  35.71 
 
 
201 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701424  hitchhiker  0.00000248326 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0473  protein of unknown function DUF1152  34.86 
 
 
530 aa  57  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2758  putative mut-like protein  35.19 
 
 
163 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2930  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0397  mutator MutT protein  37.01 
 
 
347 aa  56.2  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3935  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
180 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.445815  hitchhiker  0.00928201 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0812  NUDIX hydrolase  35.11 
 
 
166 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.64339  normal  0.9117 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0870  mutator mutT protein  35.09 
 
 
137 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  36.05 
 
 
236 aa  56.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1617  NUDIX hydrolase  34.26 
 
 
132 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2534  NUDIX hydrolase  32.48 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5502  NUDIX hydrolase  28.68 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.985254 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3595  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 
187 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00459276  normal  0.106205 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0700  NUDIX hydrolase  35 
 
 
132 aa  56.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3541  NUDIX hydrolase  33.83 
 
 
138 aa  56.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.527483  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  46.67 
 
 
143 aa  55.1  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0691  mutT/nudix family protein  30.51 
 
 
140 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8672  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  28.28 
 
 
158 aa  55.5  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0241  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
157 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.270437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5494  NUDIX hydrolase  30.93 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.202592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0677  mutT/nudix family protein  33.33 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000877041 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0884  NUDIX hydrolase  33.04 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  32.79 
 
 
147 aa  55.1  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  36.59 
 
 
152 aa  55.1  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>