More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4752 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  100 
 
 		 458 aa  888    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  43.64 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  53.91 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  60.47 
 
 		 251 aa  161  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  57.03 
 
 		 360 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  57.03 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  57.03 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  53.91 
 
 		 272 aa  151  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  56.59 
 
 		 235 aa  148  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  55.47 
 
 		 288 aa  147  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  57.72 
 
 		 320 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  55.81 
 
 		 334 aa  145  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  53.54 
 
 		 339 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  51.97 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  51.97 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  51.97 
 
 		 340 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  51.91 
 
 		 351 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  51.97 
 
 		 339 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  52.76 
 
 		 340 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  51.94 
 
 		 224 aa  137  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  50.78 
 
 		 245 aa  135  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  51.91 
 
 		 348 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  52.76 
 
 		 348 aa  133  7.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  51.67 
 
 		 727 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 		 590 aa  131  2.0000000000000002e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  51.67 
 
 		 727 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  51.61 
 
 		 199 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  48.41 
 
 		 824 aa  131  3e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  51.82 
 
 		 198 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  52.25 
 
 		 751 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  50.91 
 
 		 198 aa  126  9e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.09 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  52.03 
 
 		 195 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.04 
 
 		 236 aa  123  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  50.39 
 
 		 271 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  47.54 
 
 		 346 aa  120  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  49.17 
 
 		 511 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  45.8 
 
 		 270 aa  116  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  49.25 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  49.25 
 
 		 311 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  45 
 
 		 754 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  45.8 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  46.32 
 
 		 311 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  43.06 
 
 		 383 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  48.06 
 
 		 788 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  42.28 
 
 		 333 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3815  peptidase M23B  45.83 
 
 		 237 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  44.8 
 
 		 358 aa  112  2.0000000000000002e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  46.36 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  46.88 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  27.19 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  45.08 
 
 		 419 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  29.18 
 
 		 404 aa  107  7e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  31.16 
 
 		 375 aa  106  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  43.7 
 
 		 349 aa  106  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.46 
 
 		 274 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  46.72 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  42.74 
 
 		 491 aa  104  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  45.45 
 
 		 269 aa  103  9e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  29 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  51.43 
 
 		 294 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.39 
 
 		 282 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  25.07 
 
 		 441 aa  102  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  50.41 
 
 		 243 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  50.48 
 
 		 292 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  47.93 
 
 		 238 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  50.43 
 
 		 569 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  47.11 
 
 		 238 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  43.81 
 
 		 352 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  39.85 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1864  Peptidase M23  49.09 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.475918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  50.98 
 
 		 291 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  42.11 
 
 		 442 aa  98.6  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  39.85 
 
 		 447 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  40.6 
 
 		 446 aa  99  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.46 
 
 		 324 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  26.53 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0247  peptidase M23B  30.77 
 
 		 379 aa  97.8  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000105297  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  42.15 
 
 		 468 aa  97.8  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.44 
 
 		 321 aa  97.4  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3858  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.77 
 
 		 424 aa  96.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000135417  hitchhiker  0.00000000000537806 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  41.59 
 
 		 582 aa  96.7  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  47.32 
 
 		 247 aa  96.3  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  42.37 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  42.37 
 
 		 305 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  42.4 
 
 		 367 aa  96.3  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  42.86 
 
 		 233 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1363  Peptidase M23  40.85 
 
 		 402 aa  96.3  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.498283  normal  0.685593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  35.77 
 
 		 283 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1486  cell wall endopeptidase, family M23/M37  40.77 
 
 		 421 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000596043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  36.02 
 
 		 321 aa  95.1  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1559  peptidase M23B  46.79 
 
 		 192 aa  95.5  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  41.53 
 
 		 305 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1587  peptidase, M23/M37 family protein  42.86 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.454077  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  38.81 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0744  peptidase M23B  43.8 
 
 		 340 aa  94.7  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  40.48 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  40.94 
 
 		 278 aa  94.4  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  39.39 
 
 		 231 aa  94  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  27.78 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>