161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3555 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3555  ribonuclease BN  100 
 
 		 354 aa  684    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.862191  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1249  ribonuclease BN  46.24 
 
 		 360 aa  233  3e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00563624  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1501  ribonuclease BN  47.7 
 
 		 431 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.639318  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3495  ribonuclease BN  46.13 
 
 		 342 aa  217  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.385493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24410  predicted membrane protein  45.45 
 
 		 402 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1838  ribonuclease BN  44.44 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0195892  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2180  ribonuclease BN  44.41 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111198  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2226  ribonuclease BN  44.41 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2169  ribonuclease BN  44.41 
 
 		 321 aa  202  8e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000149157  hitchhiker  0.00191818 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3775  ribonuclease BN  39.67 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00242423  normal  0.45335 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2241  ribonuclease BN  42.99 
 
 		 426 aa  189  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3945  ribonuclease BN  42.18 
 
 		 323 aa  189  8e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1038  ribonuclease BN  43.21 
 
 		 355 aa  186  4e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2454  ribonuclease BN  42.07 
 
 		 344 aa  186  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.458983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12721  hypothetical protein  42.47 
 
 		 324 aa  185  8e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.662031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1789  ribonuclease BN  41.33 
 
 		 300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00331025  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0518  ribonuclease BN  40.14 
 
 		 298 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2354  ribonuclease BN  36.08 
 
 		 327 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.803425  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2813  ribonuclease BN  35.83 
 
 		 336 aa  162  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.934919 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6692  membrane protein-like protein  38.4 
 
 		 324 aa  162  7e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1751  ribonuclease BN  40.74 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.807347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3072  ribonuclease BN  37.59 
 
 		 361 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0634792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1887  hypothetical protein  37.23 
 
 		 433 aa  137  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.321613  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4345  ribonuclease BN  30.28 
 
 		 331 aa  93.6  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2056  ribonuclease BN  26.4 
 
 		 321 aa  83.6  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4755  putative ribonuclease BN  28.62 
 
 		 328 aa  79.3  0.00000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0442658  normal  0.0270595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4350  ribonuclease BN  26.33 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4850  YihY family protein  25.09 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0474  YihY family protein  25.09 
 
 		 288 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3781  ribonuclease BN  28.96 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.470929  normal  0.0277399 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2691  ribonuclease BN  25.65 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.911328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0418  ribonuclease BN  23.63 
 
 		 277 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00636408  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1249  ribonuclease BN, putative  26.83 
 
 		 356 aa  73.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.474718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19220  predicted membrane protein  25.86 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.234203  normal  0.518782 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2469  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 397 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4141  putative ribonuclease BN  24.46 
 
 		 320 aa  73.6  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1597  ribonuclease BN, putative  29.07 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0523  ribonuclease BN, putative  24.01 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0395  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0386  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0383  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0409  ribonuclease BN  24.01 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0523  YihY family protein  24.01 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0234  ribonuclease BN  25.49 
 
 		 319 aa  72.4  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1426  ribonuclease BN  24.79 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.568651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3912  ribonuclease BN, putative  23.63 
 
 		 386 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.561181  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0389  putative ribonuclease BN  23.66 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3860  ribonuclease BN  27.27 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0453  YihY family protein  23.67 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32910  Ribonuclease BN protein  30.89 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1421  ribonuclease BN, putative  24.91 
 
 		 392 aa  70.1  0.00000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1198  putative ribonuclease BN  25.34 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.405959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3356  ribonuclease BN  26.65 
 
 		 374 aa  70.5  0.00000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28530  hypothetical protein  27.01 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00021661 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2488  hypothetical protein  26.21 
 
 		 299 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1831  ribonuclease BN, putative  25.39 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.630422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0430  ribonuclease BN  26.64 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2132  ribonuclease BN  27.4 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.066415  normal  0.616348 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1062  ribonuclease BN  25.45 
 
 		 386 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2075  ribonuclease BN  25.51 
 
 		 328 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0751  ribonuclease BN, putative  27.99 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.232287  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2184  putative ribonuclease BN  24.29 
 
 		 276 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00880085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2397  ribonuclease BN  23.87 
 
 		 396 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2397  hypothetical protein  25.68 
 
 		 352 aa  68.2  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1381  putative ribonuclease BN  25.19 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.528846  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4560  ribonuclease BN, putative  27.85 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0251  ribonuclease BN  26.69 
 
 		 333 aa  67  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0345  putative ribonuclease BN  27.6 
 
 		 377 aa  67  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0345  ribonuclease BN  25.6 
 
 		 334 aa  66.6  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.464437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0395  putative ribonuclease BN  22.58 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4067  ribonuclease BN  27.85 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00917  putative ribonuclease protein  22.85 
 
 		 317 aa  66.2  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1329  putative ribonuclease BN  27.85 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4573  ribonuclease BN  28.57 
 
 		 293 aa  66.2  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.101037  hitchhiker  0.00311377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4670  ribonuclease BN, putative  23.69 
 
 		 296 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4597  ribonuclease BN, putative  23.96 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.144363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0983  ribonuclease BN  24.02 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.460306 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0145  ribonuclease BN  26.33 
 
 		 367 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.308506 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3110  ribonuclease BN  26.01 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4230  ribonuclease BN  28.48 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.375686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1932  ribonuclease BN  24.31 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0272  YihY family protein  21.35 
 
 		 283 aa  63.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.975594  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0281  YihY family protein  21.51 
 
 		 283 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3869  putative ribonuclease BN  26.26 
 
 		 401 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.124849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1250  ribonuclease BN  23.99 
 
 		 291 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6295  ribonuclease BN  25.07 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4297  ribonuclease BN, putative  22.48 
 
 		 384 aa  60.5  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0524586 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4509  ribonuclease BN  28.64 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.581699  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1408  ribonuclease BN, putative  32.41 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0800  ribonuclease BN  23.27 
 
 		 386 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.251545  normal  0.105485 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3031  ribonuclease BN, putative  25.96 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1225  ribonuclease BN  28.18 
 
 		 445 aa  59.3  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0874  ribonuclease BN  24.67 
 
 		 388 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0502515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4678  ribonuclease BN  25.64 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0366951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5324  ribonuclease BN  25.27 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1318  putative ribonuclease BN  23.92 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.258072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2523  ribonuclease BN  24.17 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.861907  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0834  ribonuclease BN  24.67 
 
 		 388 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.119787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5245  ribonuclease BN  26.02 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2060  ribonuclease BN, putative  26.92 
 
 		 318 aa  57  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.670045  normal  0.582678 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>