More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2984 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2984  xylulokinase  100 
 
 		 482 aa  917    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.765011  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3397  xylulokinase  73.11 
 
 		 465 aa  641    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0992186  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2065  xylulokinase  69.98 
 
 		 479 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0354  xylulokinase  71.97 
 
 		 458 aa  620  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.267797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0151  xylulokinase  70.46 
 
 		 463 aa  621  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.498151 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3972  xylulokinase  71.13 
 
 		 480 aa  614  9.999999999999999e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0262091 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4038  xylulokinase  71.79 
 
 		 465 aa  607  9.999999999999999e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3591  xylulokinase  72.59 
 
 		 486 aa  596  1e-169  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06200  D-xylulose kinase  67.22 
 
 		 492 aa  585  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1261  xylulokinase  67.09 
 
 		 482 aa  577  1.0000000000000001e-163  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00501532 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0644  xylulokinase  66.94 
 
 		 480 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.632042  normal  0.0960286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1796  xylulokinase  68.13 
 
 		 460 aa  572  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0338276  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6686  xylulokinase  68.57 
 
 		 460 aa  563  1.0000000000000001e-159  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.433412 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4755  xylulokinase  67.08 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2519  xylulokinase  64.98 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.606613  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2564  xylulokinase  64.98 
 
 		 465 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.396668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1604  xylulokinase  64.76 
 
 		 464 aa  533  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.952022  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2556  xylulokinase  64.77 
 
 		 465 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0467  xylulokinase  60.87 
 
 		 480 aa  522  1e-147  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2431  xylulokinase  62.53 
 
 		 475 aa  513  1e-144  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2828  xylulokinase  58.86 
 
 		 490 aa  506  9.999999999999999e-143  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3306  xylulokinase  64.8 
 
 		 479 aa  507  9.999999999999999e-143  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0167704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4666  xylulokinase  62.63 
 
 		 505 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.114264  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1425  xylulokinase  62.42 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.741435  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5296  xylulokinase  61.81 
 
 		 464 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.714705  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1386  xylulokinase  62.45 
 
 		 461 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188757  normal  0.0480029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04580  D-xylulose kinase  62.11 
 
 		 469 aa  484  1e-135  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.399313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2176  xylulokinase  63.26 
 
 		 472 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000507955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3253  xylulokinase  57.74 
 
 		 464 aa  465  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.100272 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1886  Xylulose kinase  50.5 
 
 		 506 aa  433  1e-120  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  unclonable  0.0000234527  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01700  D-xylulose kinase  51.26 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7020  carbohydrate kinase FGGY  47.27 
 
 		 540 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.118142 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2788  xylulokinase  44.84 
 
 		 493 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2832  xylulokinase  44.84 
 
 		 493 aa  269  8.999999999999999e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2815  xylulokinase  45.61 
 
 		 493 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0161746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3559  xylulokinase  38.56 
 
 		 510 aa  257  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0250  xylulokinase  38.18 
 
 		 498 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.82527  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2635  xylulokinase  36.26 
 
 		 498 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  39.4 
 
 		 495 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2036  xylulokinase  36.67 
 
 		 496 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0644  xylulokinase  35.91 
 
 		 498 aa  233  6e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2435  xylulokinase  36.59 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00457949 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34350  xylulose kinase  37.77 
 
 		 502 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0575074  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1989  xylulokinase  35.32 
 
 		 496 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2920  xylulose kinase  37.34 
 
 		 496 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.223361  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2702  xylulokinase  34.6 
 
 		 493 aa  218  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0029542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2285  xylulokinase  33.04 
 
 		 505 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4473  xylulokinase  35.4 
 
 		 499 aa  210  4e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.495653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00112  xylulokinase  32.75 
 
 		 497 aa  194  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.757855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0711  xylulokinase  35.06 
 
 		 493 aa  177  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.133304  normal  0.321935 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3412  xylulokinase  34.27 
 
 		 485 aa  177  5e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2505  xylulokinase  34.63 
 
 		 493 aa  176  6e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0356237  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1976  xylulokinase  36.07 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.775645  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2586  xylulokinase  36.07 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.220049  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0411  xylulokinase  32.79 
 
 		 496 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2610  xylulokinase  35.85 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.246925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3239  xylulokinase  32.52 
 
 		 493 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2634  xylulokinase  34.42 
 
 		 493 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5917  xylulokinase  34.42 
 
 		 493 aa  174  5e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0729  xylulokinase  33.33 
 
 		 493 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0831  xylulokinase  29.58 
 
 		 492 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0808  xylulokinase  29.58 
 
 		 492 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0497  xylulokinase  32.13 
 
 		 494 aa  170  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.71509  normal  0.01013 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0132  xylulokinase  34.1 
 
 		 496 aa  170  5e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.162788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2819  xylulokinase  31.65 
 
 		 484 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.416999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0702  xylulokinase  34.39 
 
 		 493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6659  xylulokinase  33.1 
 
 		 486 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0232  xylulokinase  32.79 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0154  xylulokinase  29.76 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2477  xylulokinase  34.44 
 
 		 490 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0090  xylulokinase  34.44 
 
 		 490 aa  166  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0452597  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  29.35 
 
 		 518 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0343  xylulokinase  34.44 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0642  xylulokinase  34.44 
 
 		 490 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.333334  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2128  putative D-arabinitol kinase protein  33.8 
 
 		 491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.449223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1732  xylulose kinase  31.08 
 
 		 494 aa  164  4.0000000000000004e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0097  xylulokinase  33.41 
 
 		 483 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1198  xylulokinase  34.35 
 
 		 488 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.64875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0157  xylulokinase  32.4 
 
 		 484 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1046  xylulokinase  34.43 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0884  xylulokinase  34.43 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0887  xylulokinase  34.43 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1911  xylulokinase  28.01 
 
 		 509 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.048525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0550  xylulokinase  31.86 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0548  xylulokinase  31.86 
 
 		 483 aa  159  8e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.560227  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  30.23 
 
 		 501 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0028  xylulokinase  32.46 
 
 		 483 aa  158  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.237536  normal  0.287388 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2179  xylulokinase  33.99 
 
 		 512 aa  157  4e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4103  xylulokinase  31.6 
 
 		 484 aa  157  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1079  xylulokinase  36.67 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1238  xylulokinase  36.67 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0408596  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0071  xylulokinase  36.67 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0348  xylulokinase  36.67 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2162  xylulokinase  35.41 
 
 		 485 aa  156  7e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0059  xylulokinase  36.29 
 
 		 486 aa  155  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0237  xylulokinase  36.24 
 
 		 486 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4385  xylulokinase  34.44 
 
 		 488 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3938  xylulokinase  32.72 
 
 		 484 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.856967 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4043  xylulokinase  32.72 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.145832  normal  0.120116 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4162  xylulose kinase  32.41 
 
 		 484 aa  154  4e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.0143871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>