More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2982 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2982  cytidylate kinase  100 
 
 		 229 aa  424  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  54.79 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  54.79 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  54.79 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  55 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  56.74 
 
 		 230 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  52 
 
 		 269 aa  187  2e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  55.4 
 
 		 228 aa  185  5e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  51.17 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3275  cytidylate kinase  56.11 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00480456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4424  cytidylate kinase  50.69 
 
 		 225 aa  182  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  53.52 
 
 		 223 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0979  cytidylate kinase  53.92 
 
 		 231 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1456  cytidylate kinase  53.52 
 
 		 268 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00727375 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  42.01 
 
 		 226 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.51 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1234  cytidylate kinase  51.56 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  44.09 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1496  cytidylate kinase  53.95 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4053  cytidylate kinase  53.51 
 
 		 237 aa  168  5e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.737669  normal  0.51193 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  52.36 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1021  cytidylate kinase  42.45 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1614  cytidylate kinase  54.87 
 
 		 239 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  42.27 
 
 		 226 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  41.28 
 
 		 230 aa  165  5e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 229 aa  161  7e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  41.59 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  49.54 
 
 		 252 aa  160  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.82 
 
 		 527 aa  160  2e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  39.91 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1209  cytidylate kinase  49.12 
 
 		 240 aa  159  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  41.07 
 
 		 227 aa  159  4e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  44 
 
 		 514 aa  158  6e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1920  cytidylate kinase  54.72 
 
 		 226 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011282 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  40.28 
 
 		 517 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  40.55 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.87 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2501  cytidylate kinase  52.76 
 
 		 243 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.837202  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  42.2 
 
 		 227 aa  156  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  40.93 
 
 		 225 aa  156  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.36 
 
 		 516 aa  155  4e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  38.6 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.62 
 
 		 529 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  36.36 
 
 		 516 aa  155  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1705  cytidylate kinase  46.3 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000535126  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  41.23 
 
 		 225 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.37 
 
 		 488 aa  154  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.91 
 
 		 483 aa  153  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  44.34 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  41.31 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  36.57 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1335  cytidylate kinase  41.47 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.059192  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1536  cytidylate kinase  47.85 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0931424  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  39.91 
 
 		 528 aa  151  8.999999999999999e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  39.81 
 
 		 224 aa  151  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.5 
 
 		 480 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  40.85 
 
 		 225 aa  150  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  43.69 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  42.47 
 
 		 224 aa  149  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.99 
 
 		 526 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5059  cytidylate kinase  51.4 
 
 		 225 aa  148  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0373389  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  42.34 
 
 		 539 aa  148  6e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1351  cytidylate kinase  41.01 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0401638  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2117  cytidylate kinase  43.66 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000190032  unclonable  0.00000899897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  41.63 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1440  cytidylate kinase  48.2 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00955651  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06850  cytidylate kinase  48.85 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.734775  normal  0.308288 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  46.54 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2140  cytidylate kinase  39.35 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  39.64 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  37.39 
 
 		 224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0934  cytidylate kinase  36.32 
 
 		 213 aa  145  3e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  38.99 
 
 		 225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  46.31 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  42.29 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.1 
 
 		 511 aa  145  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0688  cytidylate kinase  46.81 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1515  cytidylate kinase  45.07 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  41.1 
 
 		 511 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  44.04 
 
 		 225 aa  144  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1929  cytidylate kinase  53.77 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.339445  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  40.97 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5748  cytidylate kinase  39.11 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0113044 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.43 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  39.07 
 
 		 228 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  38.53 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1729  cytidylate kinase  38.5 
 
 		 223 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  36.19 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2351  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2439  cytidylate kinase  45.33 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0331  cytidylate kinase  39.19 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>