More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2340 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2340  Luciferase-like, subgroup  100 
 
 
342 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0141326  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3890  luciferase-like protein  61.72 
 
 
340 aa  422  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.616803 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3657  Luciferase-like monooxygenase  57.52 
 
 
340 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.0303033 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6633  Luciferase-like monooxygenase  61.18 
 
 
344 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6837  Luciferase-like monooxygenase  57.18 
 
 
345 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.119181  normal  0.205384 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1993  Luciferase-like monooxygenase  59.71 
 
 
348 aa  371  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1675  luciferase family protein  59.12 
 
 
348 aa  369  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3314  monooxygenase  55.59 
 
 
352 aa  366  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3123  Luciferase-like monooxygenase  54.97 
 
 
354 aa  363  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.729871  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2854  Luciferase-like monooxygenase  54.97 
 
 
353 aa  362  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100669  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3319  luciferase family protein  53.69 
 
 
340 aa  353  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.231946  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4507  luciferase family protein  56.05 
 
 
347 aa  350  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.714194 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2381  Luciferase-like monooxygenase  56.47 
 
 
355 aa  347  1e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.715687  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4479  luciferase family protein  53.67 
 
 
345 aa  340  2.9999999999999998e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0010  Luciferase-like monooxygenase  54.57 
 
 
356 aa  335  3.9999999999999995e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2684  Luciferase-like monooxygenase  56.93 
 
 
355 aa  335  7e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.301782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1449  Luciferase-like monooxygenase  48.54 
 
 
345 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.537793 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2764  luciferase family protein  53.5 
 
 
377 aa  327  3e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0691777  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1252  luciferase-like protein  53.85 
 
 
367 aa  323  3e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.334812  normal  0.775678 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2486  Luciferase-like monooxygenase  52.2 
 
 
367 aa  321  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000818407 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0535  Luciferase-like monooxygenase  52.33 
 
 
349 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0613  luciferase-like protein  48.97 
 
 
350 aa  312  5.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0428  oxidoreductase ( coenzyme F420-dependent N5,N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase)  47.17 
 
 
343 aa  312  6.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02730  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  48.67 
 
 
347 aa  301  1e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.844523  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2762  Luciferase-like monooxygenase  48.31 
 
 
364 aa  295  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.150269  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2688  Luciferase-like monooxygenase  44.9 
 
 
344 aa  290  2e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078022 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0731  luciferase family protein  40.88 
 
 
347 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5859  luciferase family protein  48.82 
 
 
363 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2311  Luciferase-like monooxygenase  46.18 
 
 
345 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0990419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7516  putative alkanal monooxygenase  46.61 
 
 
345 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0890739  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1952  luciferase family protein  46.63 
 
 
343 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2258  luciferase-like protein  47.02 
 
 
358 aa  276  3e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  46.13 
 
 
345 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1229  luciferase family protein  44.87 
 
 
343 aa  265  8e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2571  putative oxidoreductase protein  44.87 
 
 
345 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1967  luciferase family protein  44.54 
 
 
366 aa  258  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1759  luciferase-like monooxygenase  38.35 
 
 
351 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1941  luciferase family protein  37.76 
 
 
351 aa  232  6e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1977  luciferase family protein  38.05 
 
 
352 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.94437e-17 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1776  luciferase-like monooxygenase  38.05 
 
 
351 aa  232  9e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3387  luciferase family protein  38.35 
 
 
351 aa  231  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.351449  hitchhiker  0.000000000482857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0389  Luciferase-like monooxygenase  46.2 
 
 
330 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2020  luciferase family protein  37.76 
 
 
351 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.123786  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1802  luciferase family protein  37.91 
 
 
351 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1942  luciferase family protein  37.91 
 
 
351 aa  228  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1808  luciferase family protein  36.58 
 
 
351 aa  222  6e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491562  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2185  luciferase family protein  42.68 
 
 
345 aa  219  7e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2041  luciferase family protein  36.87 
 
 
352 aa  212  9e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0397  luciferase family protein  38.12 
 
 
353 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0387  luciferase family protein  38.12 
 
 
353 aa  203  3e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000173024  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1042  luciferase family protein  36.57 
 
 
358 aa  191  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548372  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3878  luciferase-like monooxygenase  34.26 
 
 
357 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.219213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34610  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  34.53 
 
 
365 aa  169  7e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.767315  normal  0.560922 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1594  luciferase-like monooxygenase  34.34 
 
 
359 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.200375 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3707  Luciferase-like monooxygenase  34.39 
 
 
377 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3907  luciferase family protein  35.92 
 
 
734 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.139361  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3794  Luciferase-like monooxygenase  31.94 
 
 
374 aa  152  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.626984  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2314  luciferase family protein  32.64 
 
 
361 aa  152  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.857233  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28920  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.97 
 
 
387 aa  149  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.327386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0819  luciferase-like monooxygenase  32.05 
 
 
349 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1932  luciferase family protein  31.86 
 
 
396 aa  145  9e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.936337  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4827  luciferase family protein  32.74 
 
 
352 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0504793  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0703  luciferase-like  30.97 
 
 
378 aa  143  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00489666  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2551  luciferase family protein  29.79 
 
 
374 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.726432  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1814  luciferase family protein  32.15 
 
 
367 aa  136  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.440948  normal  0.0668716 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2288  Luciferase-like monooxygenase  29.2 
 
 
369 aa  135  9.999999999999999e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000270787 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1930  putative monooxygenase  30 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.699322  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2829  Luciferase-like, subgroup  30 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783781  hitchhiker  0.00301376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2284  Luciferase-like monooxygenase  29.15 
 
 
382 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170982  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  30.09 
 
 
366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.267791 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0569  Luciferase-like monooxygenase  30.38 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  0.327151 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1938  luciferase family protein  30.09 
 
 
380 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.107007  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3586  luciferase-like protein  30.97 
 
 
372 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0195616  normal  0.348111 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2154  Luciferase-like, subgroup  29.03 
 
 
365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0618326  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2468  Luciferase-like, subgroup  30.97 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.874778 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4581  Luciferase-like monooxygenase  30.21 
 
 
371 aa  126  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07450  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  27.49 
 
 
396 aa  122  6e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0546352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1773  Luciferase-like monooxygenase  28.28 
 
 
410 aa  122  6e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.59166  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19770  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.91 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000302603  normal  0.0229547 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5363  luciferase family protein  31.21 
 
 
481 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2006  Luciferase-like, subgroup  30.74 
 
 
377 aa  120  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.528515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1100  Luciferase-like, subgroup  29.62 
 
 
367 aa  120  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.43762 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1404  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  44.03 
 
 
145 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1723  Luciferase-like monooxygenase  29.2 
 
 
386 aa  118  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.655893  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3728  luciferase-like protein  33.33 
 
 
376 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.755496  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6239  luciferase family protein  31.96 
 
 
402 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.46641  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18700  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.5 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2597  luciferase family protein  33.33 
 
 
374 aa  109  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1277  Luciferase-like monooxygenase  29.53 
 
 
376 aa  109  7.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2104  luciferase family protein  33.33 
 
 
353 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0734  luciferase-like monooxygenase  30.32 
 
 
364 aa  100  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2704  Luciferase-like monooxygenase  28.99 
 
 
362 aa  97.4  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.682555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8163  Luciferase-like monooxygenase  28.65 
 
 
386 aa  97.8  3e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4242  luciferase family protein  30.06 
 
 
439 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3783  luciferase-like protein  30.35 
 
 
436 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3856  luciferase family protein  30.35 
 
 
436 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92968  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3787  luciferase family protein  30.35 
 
 
436 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82218  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4140  luciferase-like  26.7 
 
 
354 aa  92.8  7e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.784966  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2368  Luciferase-like, subgroup  24.75 
 
 
341 aa  90.5  4e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2404  luciferase family protein  29.77 
 
 
439 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>