268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2316 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2316  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 296 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.450046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3585  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  60.28 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.992183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0072  ornithine cyclodeaminase  50.34 
 
 		 306 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  47.32 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  45.21 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  39.1 
 
 		 326 aa  121  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  36.09 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  33.21 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  35.09 
 
 		 325 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  33.93 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  28.73 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  28.36 
 
 		 323 aa  112  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.53 
 
 		 328 aa  113  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  34.85 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 325 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  36.06 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  32.21 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  33.83 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  28.76 
 
 		 324 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  38.85 
 
 		 326 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  34.44 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  37.55 
 
 		 297 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  33.96 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  37.58 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  34.21 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3503  ornithine cyclodeaminase  28.42 
 
 		 318 aa  106  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.599895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4907  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.44 
 
 		 311 aa  105  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.859869  normal  0.025837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  31.32 
 
 		 316 aa  105  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  34.59 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.82 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1353  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  26.69 
 
 		 309 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2927  ornithine cyclodeaminase  35.43 
 
 		 305 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  28.36 
 
 		 318 aa  104  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  30.41 
 
 		 314 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1799  ornithine cyclodeaminase  31.56 
 
 		 298 aa  102  5e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4263  ornithine cyclodeaminase  34.62 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  36.43 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  32.38 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 338 aa  99.8  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  31.45 
 
 		 311 aa  98.6  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2557  Ornithine cyclodeaminase  32.18 
 
 		 314 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.852397  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  33.09 
 
 		 318 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2251  Ornithine cyclodeaminase  31.94 
 
 		 313 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.217432  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0068  ornithine cyclodeaminase  33.01 
 
 		 318 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.783844  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1765  ornithine cyclodeaminase/Mu-crystallin family protein  31.95 
 
 		 466 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00340839 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.44 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  34 
 
 		 319 aa  96.3  6e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.34 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 		 320 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  40.49 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0460  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.8 
 
 		 321 aa  94.4  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.534041  normal  0.268997 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.71 
 
 		 310 aa  94.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 		 320 aa  93.2  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0204  ornithine cyclodeaminase  31.99 
 
 		 316 aa  93.2  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.358948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1663  ornithine cyclodeaminase  34.15 
 
 		 311 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037866  normal  0.0691504 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  39.3 
 
 		 315 aa  92  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  30.9 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  28.16 
 
 		 326 aa  91.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5997  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003670  ornithine cyclodeaminase  28.16 
 
 		 324 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4240  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 311 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00241328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.38 
 
 		 313 aa  90.5  3e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1185  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.87 
 
 		 316 aa  90.9  3e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3343  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.87 
 
 		 305 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0515229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3766  ornithine cyclodeaminase  34.81 
 
 		 311 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.0546464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4197  ornithine cyclodeaminase  33.72 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.19 
 
 		 305 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1519  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  33.07 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4010  ornithine cyclodeaminase  34.44 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4357  ornithine cyclodeaminase  34.44 
 
 		 325 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.63 
 
 		 328 aa  87  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  28.67 
 
 		 326 aa  86.3  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2610  ornithine cyclodeaminase  28.32 
 
 		 317 aa  86.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.329826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4424  Ornithine cyclodeaminase  34.3 
 
 		 315 aa  85.9  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 320 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0266  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.45 
 
 		 318 aa  84.3  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1290  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3381  ornithine cyclodeaminase  33.57 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.67248  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0536  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1031  ornithine cyclodeaminase  34.04 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.78 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.67 
 
 		 319 aa  84  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1291  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1371  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 317 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1457  ornithine cyclodeaminase  35.02 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  28.32 
 
 		 329 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  34.31 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.09 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  34.6 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2543  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 370 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0739347  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  28.9 
 
 		 329 aa  82.8  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  29.41 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  31.87 
 
 		 321 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  28.69 
 
 		 333 aa  81.6  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1539  ornithine cyclodeaminase  33.58 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00484883  normal  0.0982373 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  29.92 
 
 		 321 aa  80.9  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>