215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2203 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2203  Helix-turn-helix, AraC domain protein  100 
 
 		 311 aa  607  9.999999999999999e-173  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.263082  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0988  transcriptional regulator, AraC family  64.05 
 
 		 310 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0224549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2735  Helix-turn-helix, AraC domain protein  59.93 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.395  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2893  Helix-turn-helix, AraC domain protein  54.28 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0214  AraC family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0224  AraC family transcriptional regulator  48.5 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0236  helix-turn-helix domain-containing protein  47.25 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0724046 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0432  helix-turn-helix domain-containing protein  47.73 
 
 		 307 aa  255  6e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.212482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0204  AraC family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 273 aa  236  4e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.908261 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2438  Helix-turn-helix, AraC domain protein  39.1 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170886  normal  0.130727 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  44.79 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1692  AraC family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000028699  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1049  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000110999  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2370  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 275 aa  55.5  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.737872 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2703  transcription activator, effector binding  38.38 
 
 		 326 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.268178 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4210  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 299 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000259018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0618  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105124  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1097  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000000022105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1056  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000221071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 277 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2206  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 303 aa  54.3  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000287978  normal  0.709471 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0977  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 300 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000786642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1217  transcription activator, effector binding  34.02 
 
 		 288 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0973  AraC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 300 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000577914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2935  transcriptional regulator, AraC family  41.03 
 
 		 276 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000465121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  27.61 
 
 		 289 aa  53.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3503  transcription activator, effector binding  38.78 
 
 		 294 aa  52.4  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00111619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3526  transcription activator, effector binding  34.69 
 
 		 288 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3356  transcription activator, effector binding  34.69 
 
 		 288 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5827  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 279 aa  52  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0649  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.64 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  37.63 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3431  transcription activator, effector binding  33.67 
 
 		 288 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3425  transcription activator, effector binding  33.67 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0104  AraC family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 324 aa  50.8  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 154 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 292 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  38.46 
 
 		 291 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  34.62 
 
 		 304 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 287 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  31.52 
 
 		 299 aa  50.4  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  34.74 
 
 		 129 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2978  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 297 aa  49.7  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  32.28 
 
 		 144 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 329 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 284 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 134 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 299 aa  49.3  0.00009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6884  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 301 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 277 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2442  AraC family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5359  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.6789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1474  transcriptional regulator, AraC family  32.99 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  37.62 
 
 		 140 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0805  AraC family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000161693  normal  0.19096 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2158  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 294 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0165  AraC family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 298 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2404  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 266 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2206  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 317 aa  48.1  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43820  putative transcriptional regulator  36.27 
 
 		 260 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 353 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0034  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 279 aa  47.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.255751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3564  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 279 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2173  AraC family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 289 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.671765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  42.5 
 
 		 295 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0991  AraC family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 270 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1536  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4658  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0072  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 322 aa  47  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.783427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3705  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.14672  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3816  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 266 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0851  helix-turn-helix domain-containing protein  57.5 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.79639  normal  0.0269486 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1171  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0384814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0040  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 268 aa  46.6  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.451948  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2573  AraC/XylS family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 270 aa  47  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2493  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 299 aa  46.6  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000346931  normal  0.0115142 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3953  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 287 aa  46.2  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0509927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4026  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 267 aa  46.6  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5029  AraC family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 268 aa  46.6  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31589  normal  0.688219 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1576  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 436 aa  46.2  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2982  transcriptional regulator, AraC family  31.78 
 
 		 273 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.184639  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1644  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 333 aa  46.2  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000273212  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3675  putative transcriptional regulator  35.29 
 
 		 260 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  34.41 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2466  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 306 aa  46.2  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04745  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 255 aa  46.2  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1905  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.47 
 
 		 668 aa  46.2  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0295515  normal  0.210974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0132  transcription regulator protein  39.47 
 
 		 265 aa  46.2  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1774  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 289 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.524324  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1222  AraC family transcriptional regulator  31 
 
 		 292 aa  45.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0178453  normal  0.17813 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  36.56 
 
 		 160 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3099  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1683  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 221 aa  45.4  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>